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Enregistrement W2587251545 · doi:10.2135/cropsci2016.06.0452

SSR Allelic Diversity Shifts in Zoysiagrass (<i>Zoysia</i> spp.) Cultivars Released from 1910 to 2016

2017· article· en· W2587251545 sur OpenAlexfundno aff
Kelly Anne Moore, M. Carolina Zuleta, Aaron J. Patton, Brian M. Schwartz, Goretti Aranaz Novaliches, Susana R. Milla‐Lewis

Notice bibliographique

RevueCrop Science · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueTurfgrass Adaptation and Management
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food CanadaNorth Carolina State UniversityPurdue UniversityU.S. Department of Agriculture
Mots-clésBiologyGermplasmGenetic diversityAlleleCultivarPopulationAgronomyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Selection during varietal improvement has been shown to reduce genetic diversity in several different crop species. A reduction in genetic diversity can be detrimental to future breeding efforts and increase susceptibility to biotic stresses. The purpose of this study was to analyze changes in levels of allelic diversity at the gene and population levels in 40 zoysiagrass (Zoysia spp. Willd.) cultivars released between 1910 and 2016 using simple sequence repeat (SSR) markers. Fifty‐six SSR primer pairs were used to determine whether allelic diversity has changed among cultivars released over a century of modern plant breeding. While no significant differences were observed for total numbers of alleles or genetic similarity values between the initial and most recent time periods, our results demonstrate that genetic diversity among zoysiagrass cultivars has fluctuated over time. Allelic diversity declined during the 1990s and then recovered during 2000s. STRUCTURE analysis revealed five subpopulations with varying levels of admixture and that, for the most part, good representation of these subpopulations has been maintained over the different decades of release. These findings illustrate that plant breeding has not resulted in a substantial decline in zoysiagrass genetic diversity, but also that the potential exists for increasing diversity through future germplasm collections and the inclusion of less‐used Zoysia species to create new combinations of alleles.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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