SSR Allelic Diversity Shifts in Zoysiagrass (<i>Zoysia</i> spp.) Cultivars Released from 1910 to 2016
Notice bibliographique
Résumé
Selection during varietal improvement has been shown to reduce genetic diversity in several different crop species. A reduction in genetic diversity can be detrimental to future breeding efforts and increase susceptibility to biotic stresses. The purpose of this study was to analyze changes in levels of allelic diversity at the gene and population levels in 40 zoysiagrass (Zoysia spp. Willd.) cultivars released between 1910 and 2016 using simple sequence repeat (SSR) markers. Fifty‐six SSR primer pairs were used to determine whether allelic diversity has changed among cultivars released over a century of modern plant breeding. While no significant differences were observed for total numbers of alleles or genetic similarity values between the initial and most recent time periods, our results demonstrate that genetic diversity among zoysiagrass cultivars has fluctuated over time. Allelic diversity declined during the 1990s and then recovered during 2000s. STRUCTURE analysis revealed five subpopulations with varying levels of admixture and that, for the most part, good representation of these subpopulations has been maintained over the different decades of release. These findings illustrate that plant breeding has not resulted in a substantial decline in zoysiagrass genetic diversity, but also that the potential exists for increasing diversity through future germplasm collections and the inclusion of less‐used Zoysia species to create new combinations of alleles.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».