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Enregistrement W2587881878 · doi:10.1038/srep42609

Loss of OxyR reduces efficacy of oxygen respiration in Shewanella oneidensis

2017· article· en· W2587881878 sur OpenAlexfundno aff
Fen Wan, Miaomiao Shi, Haichun Gao

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial Fuel Cells and Bioremediation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesFundamental Research Funds for the Central UniversitiesNatural Science Foundation of Zhejiang ProvinceNational Natural Science Foundation of ChinaPetroleum Technology Alliance Canada
Mots-clésShewanella oneidensisCytochromeRegulatorShewanellaCytochrome c oxidaseRespirationElectron transport chainCell biologyBacteriaCellular respirationBiologyCytochrome cCompartment (ship)ChemistryBiochemistryMitochondrionGeneEnzymeGeneticsBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract In many bacteria, OxyR is the major regulator controlling cellular response to H 2 O 2 . A common phenotype resulting from OxyR loss is reduced growth rate, but the underlying mechanism is unknown. We demonstrated in Shewanella oneidensis , an important research model for applied and environmental microbes, that the defect is primarily due to an electron shortage to major terminal oxidase cytochrome cbb 3 . The loss of OxyR leads to enhanced production of electron carriers that compete for electrons against cytochrome cbb 3 , cytochrome bd in particular. We further showed that the oxyR mutation also results in increased production of menaquinone, an additional means to lessen electrons to cytochrome cbb 3 . Although regulation of OxyR on these biological processes appears to be indirect, these data indicate that the regulator plays a previously underappreciated role in mediating respiration.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,225
Score d'incertitude au seuil0,464

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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