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Enregistrement W2588940498 · doi:10.1093/ofid/ofw172.929

Clinical Outcomes of Achromobacter Species in Adult Cystic Fibrosis Patients: A Cohort Study

2016· article· en· W2588940498 sur OpenAlexaffabout
Brett Edwards, Ranjani Somayaji, Jasper Wong, Harvey Rabin, Michael D. Parkins

Notice bibliographique

RevueOpen Forum Infectious Diseases · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInfections and bacterial resistance
Établissements canadiensAlberta Health ServicesUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineCystic fibrosisCohortPathogenic organismAchromobacterInternal medicineCohort studyMicrobiologyGeneticsBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background. The clinical significance of lung infection in cystic fibrosis (CF) due to classic pathogens is well established. However, Achromobacter species are Gram-negative pathogens increasingly recognized in CF with unclear clinical impact as the evidence is restricted to small European studies. Methods. We conducted a cohort study of CF patients attending a Canadian CF clinic who cultured Achromobacter species in their sputum between 1984 and 2015 to assess the prevalence and clinical impact of infection. Achromobacter was categorized as intermittent (minimum 1 positive culture) or chronic infection (≥2 positive cultures) in the preceding 12 months. Data was collected for a 2-year period prior to and following first Achromobacter isolation. Primary outcome was the proportion of patients with pulmonary exacerbation (PEx) at time of first isolation. Next, those with chronic infection were matched with 2:1 age and sex-matched controls with no history of Achromobacter infection. Multivariable mixed effects models were used to assess rate of PEx and lung function decline. Results. There were 34 patients (11% of clinical cohort) with median age 24.8 (IQR 20.6–30.8) and median BMI of 19.4 kg/m2 (IQR 18.1–22.1) included. Of these, 10 patients (29%) developed chronic infection in the study period, though they did not differ in baseline lung function. 14 patients (41%; 95% CI 25-58%) had a PEx at first isolation and of these, 4 (29%) were severe PEx. Achromobacter isolates displayed multi-drug resistance with resistance rates of 80% to aztreonam, 86% to tobramycin, and 43% to ticarcillin. There was no association of infection with rate of PEx or lung function decline in the total cohort (pre- versus post-index infection) or in the matched cohort. Conclusion. In this Canadian CF cohort, Achromobacter species infection was associated with frequent PEx, including severe PEx, at time of initial isolation but not with increased subsequent PEx risk or lung function decline. Larger multi-center studies are required to further understand the impact of Achromobacter infection in CF. Disclosures. All authors: No reported disclosures

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,438

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,285
Écart entre enseignants0,278 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
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Résumé présentoui

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