Molecular analysis of the epidermal growth factor receptor (EGFR) gene and protein expression in patients treated with erlotinib in National Cancer Institute of Canada Clinical Trials Group (NCIC CTG) trial BR.21
Notice bibliographique
Résumé
7007 Background: BR.21 demonstrated a significant survival benefit for patients with advanced NSCLC who received erlotinib vs placebo (Shepherd, ASCO 2004). While EGFR expression is common in NSCLC, protein expression by immunohistochemistry (IHC) does not appear to predict response to EGFR tyrosine kinase inhibitors (TKI). Point mutations and/or short deletions in exons 18–22 of the EGFR gene may predict response to EGFR TKIs. In BR.21, EGFR expression by IHC did not predict response. The predictive value of EGFR mutations (MUT) or gene amplification (AMP) on survival have not yet been reported. Methods: 731 patients were randomized to BR.21 (488 erlotinib, 243 placebo). IHC for EGFR expression was evaluated for 325 patients in formalin-fixed, paraffin embedded tumor specimens. 213/325 samples were suitable for molecular analyses for MUT and/or fluorescent in situ hybridization (FISH) studies for AMP. Results: 184/325 samples showed >10% EGFR staining by IHC. The HR for survival was 0.7 for patients with >10% EGFR expression compared to 0.9 for those without. EGFR gene data presently are available for 106/213 patients; this subset was significantly more likely to have had adenocarcinoma (adeno), >1 prior regimen, > time from diagnosis to randomization. 12 mutations/deletions in exons 19 and 21 were identified (10 adeno) in the 106 patients. FISH was performed successfully in 68/106 patients; 20 samples had AMP arising from polysomic gain or high copy number AMP (14/20 adeno). 4 patients had MUT + AMP, 3 MUT without AMP and in 5 patients with MUT, FISH was not successful. In this preliminary subset of 106 patients, 3 had complete or partial response; all 3 patients had AMP but no MUT. Analyses of additional EGFR gene exons and of the remaining samples are ongoing and will be correlated with survival. Conclusion: Erlotinib appears to have a greater effect on survival in patients with EGFR protein expression. In a small, preliminary subset, EGFR amplification appears a better predictor of response than EGFR mutation. Additional gene assays and survival analyses will be completed shortly. Author Disclosure Employment or Leadership Consultant or Advisory Role Stock Ownership Honoraria Research Funding Expert Testimony Other Remuneration OSI OSI
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».