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Enregistrement W2590948392 · doi:10.1128/aac.01997-16

Exopolysaccharide-Repressing Small Molecules with Antibiofilm and Antivirulence Activity against Pseudomonas aeruginosa

2017· article· en· W2590948392 sur OpenAlexafffund
Erik van Tilburg Bernardes, Laetitia Charron‐Mazenod, David J. Reading, Shauna Reckseidler-Zenteno, Shawn Lewenza

Notice bibliographique

RevueAntimicrobial Agents and Chemotherapy · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial biofilms and quorum sensing
Établissements canadiensAthabasca UniversityUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaGovernment of Canada
Mots-clésPseudomonas aeruginosaMicrobiologyBiofilmChemistryPseudomonadaceaePseudomonadalesBiologyBacteriaGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Biofilm formation is a universal virulence strategy in which bacteria grow in dense microbial communities enmeshed within a polymeric extracellular matrix that protects them from antibiotic exposure and the immune system. Pseudomonas aeruginosa is an archetypal biofilm-forming organism that utilizes a biofilm growth strategy to cause chronic lung infections in cystic fibrosis (CF) patients. The extracellular matrix of P. aeruginosa biofilms is comprised mainly of exopolysaccharides (EPS) and DNA. Both mucoid and nonmucoid isolates of P. aeruginosa produce the Pel and Psl EPS, each of which have important roles in antibiotic resistance, biofilm formation, and immune evasion. Given the central importance of the EPS for biofilms, they are attractive targets for novel anti-infective compounds. In this study, we used a high-throughput gene expression screen to identify compounds that repress expression of the pel genes. The pel repressors demonstrated antibiofilm activity against microplate and flow chamber biofilms formed by wild-type and hyperbiofilm-forming strains. To determine the potential role of EPS in virulence, pel / psl mutants were shown to have reduced virulence in feeding behavior and slow killing virulence assays in Caenorhabditis elegans . The antibiofilm molecules also reduced P. aeruginosa PAO1 virulence in the nematode slow killing model. Importantly, the combination of antibiotics and antibiofilm compounds increased killing of P. aeruginosa biofilms. These small molecules represent a novel anti-infective strategy for the possible treatment of chronic P. aeruginosa infections.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations57
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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