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Enregistrement W2592168235 · doi:10.1093/botlinnean/bow005

Allopolyploid origin of the leafy liverwort Plagiochila britannica (Plagiochilaceae)

2017· article· it· W2592168235 sur OpenAlexaboutno aff
Elisabeth V. I. Barbulescu, Simon D. F. Patzak, Kathrin Feldberg, Alfons Schäfer‐Verwimp, David S. Rycroft, Matt A. M. Renner, Jochen Heinrichs

Notice bibliographique

RevueBotanical Journal of the Linnean Society · 2017
Typearticle
Langueit
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueBryophyte Studies and Records
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyLineage (genetic)BotanyGenusLeafyChloroplast DNATaxonEvolutionary biologyPhylogenetic treeGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Allopolyploidy is an important mode of speciation in angiosperms, ferns and mosses, but has been considered of little importance in liverworts. The few known examples include taxa of the simple thalloid genus Pellia, the complex thalloid genera Corsinia, Reboulia and Targionia and the leafy liverworts Barbilophozia, Calypogeia and Porella. The diploid Plagiochila britannica has alternatively been considered an autopolyploid derivative of Plagiochila porelloides or an allopolyploid of Plagiochila asplenioides and P. porelloides; however, experimental evidence is still lacking. Here we present phylogenetic analyses of the P. asplenioides-P. britannica-P. porelloides complex based on a sampling of 37 accessions and plastid DNA rps4 and rbcL and nuclear ribosomal ITS1-5.8S-ITS2 sequences. Plastid DNA sequences of four accessions of P. britannica cluster with P. asplenioides, whereas nrITS sequences of P. britannica cluster with P. porelloides. We thus conclude that P. britannica is an allopolyploid hybrid of P. asplenioides and P. porelloides, with P. asplenioides the probable donor of the plastome and P. porelloides of the nuclear DNA. Contrary to earlier belief, P. britannica is not closely related to Plagiochila arctica. European and North American accessions of P. porelloides form sister lineages. A putative accession of P. asplenioides from Canada forms a separate lineage and may represent another taxon.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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