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Enregistrement W2592248586 · doi:10.1093/nar/gkx153

Antibiotics trigger initiation of SCCmec transfer by inducing SOS responses

2017· article· en· W2592248586 sur OpenAlexaff
Pilong Liu, Zhaowei Wu, Huping Xue, Xin Zhao

Notice bibliographique

RevueNucleic Acids Research · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAntibiotic Resistance in Bacteria
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRepressor lexASCCmecBiologySOS responseMicrobiologyAntibioticsAntibiotic resistanceHorizontal gene transferMobile genetic elementsRegulonGeneticsRepressorGeneRegulation of gene expressionMethicillin-resistant Staphylococcus aureusGene expressionPlasmidStaphylococcus aureusDNA repairBacteriaGenome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The rise of antimicrobial resistance limits therapeutic options for infections by methicillin-resistant staphylococci. The staphylococcal cassette chromosome mec (SCCmec) is a mobile genetic element as the only carrier of the methicillin-resistance determinants, the mecA or mecC gene. The use of antibiotics increases the spread of antibiotic resistance, but the mechanism by which antibiotics promote horizontal dissemination of SCCmec is largely unknown. In this study, we demonstrate that many antibiotics, including β-lactams, can induce the expression of ccrC1 and SCCmec excision from the bacterial chromosome. In particular, three widely used antibiotics targeting DNA replication and repair (sulfamethoxazole, ciprofloxacin and trimethoprim) induced higher levels of ccrC1 expression and higher rates of SCCmec excision even at low concentrations (1/8 × minimum inhibitory concentration). LexA was identified as a repressor of ccrC1 and ccrAB by binding to the promoter regions of ccrC1 and ccrAB. The activation of RecA after antibiotic induction alleviated the repression by LexA and increased the expression of ccrC1 or ccrAB, consequently increasing the excision frequency of the SCCmec for SCCmec transfer. These findings lead us to propose a mechanism by which antimicrobial agents can promote horizontal gene transfer of the mecA gene and facilitate the spread of methicillin resistance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,059
Tête enseignante GPT0,371
Écart entre enseignants0,312 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations42
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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