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Enregistrement W2594114810 · doi:10.1042/bcj20160832

Binding and inhibition of the ternary complex factor Elk-4/Sap1 by the adapter protein Dok-4

2017· article· en· W2594114810 sur OpenAlexafffund
Erika Hooker, Cindy Baldwin, Victoria Roodman, Anupam Batra, Naajia Nur Isa, Tomoko Takano, Serge Lemay

Notice bibliographique

RevueBiochemical Journal · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueNuclear Structure and Function
Établissements canadiensMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésTransactivationBiologyTernary complexCell biologyPleckstrin homology domainSignal transducing adaptor proteinMolecular biologyBinding siteGRB2Signal transductionBiochemistryTranscription factorEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The adapter protein Dok-4 (downstream of kinase-4) has been reported as both an activator and inhibitor of Erk and Elk-1, but lack of knowledge about the identity of its partner molecules has precluded any mechanistic insight into these seemingly conflicting properties. We report that Dok-4 interacts with the transactivation domain of Elk-4 through an atypical phosphotyrosine-binding domain-mediated interaction. Dok-4 possesses a nuclear export signal and can relocalize Elk-4 from nucleus to cytosol, whereas Elk-4 possesses two nuclear localization signals that restrict interaction with Dok-4. The Elk-4 protein, unlike Elk-1, is highly unstable in the presence of Dok-4, through both an interaction-dependent mechanism and a pleckstrin homology domain-dependent but interaction-independent mechanism. This is reversed by proteasome inhibition, depletion of endogenous Dok-4 or lysine-to-arginine mutation of putative Elk-4 ubiquitination sites. Finally, Elk-4 transactivation is potently inhibited by Dok-4 overexpression but enhanced by Dok-4 knockdown in MDCK renal tubular cells, which correlates with increased basal and EGF-induced expression of Egr-1, Fos and cylcinD1 mRNA, and cell proliferation despite reduced Erk activation. Thus, Dok-4 can target Elk-4 activity through multiple mechanisms, including binding of the transactivation domain, nuclear exclusion and protein destabilization, without a requirement for inhibition of Erk.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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