Ferritin Heavy Chain, a Repressor of the Human β-Globin Gene That Binds a Conserved Cagtgc Motif, Is Bound to the Repressed β-Globin Promoter In Vivo in K562 Cells and Specifically Binds an Analogous Site in the Mouse βMajor-Globin Promoter.
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Ferritin heavy chain (FH), an embryonically-expressed protein in the erythroid lineage, localizes to the nucleus and represses the human adult β-globin promoter in transient expression assays (Broyles et al., PNAS98: 9145, 2001). Recently, we have performed chromatin immunoprecipitation (ChIP) assays with cross-linked chromatin of K562 cells in which the β-globin gene is repressed, using anti-FH polyclonal antisera. These results strongly indicate that FH occupies the repression site (a CAGTGC motif) in vivo. Binding to this -150 site has been previously demonstrated to be required for β-promoter repression in co-transfections. EMSA assays (competitive gel shifts) have revealed that the mouse βMajor-globin promoter has an analogous CAGTGN motif at -160 bp from the cap site that competes specifically with the human CAGTGC site for FH binding. The mouse βMinor-globin promoter lacks the -150/-160 CAGTGN motif and, therefore, the FH binding site. Thus, a human FH transgenic mouse, in which the FH gene is driven by a truncated β-promoter lacking the CAGTGN motif, should express human FH in definitive erythroid cells where the FH would be predicted to repress βMajor-globin but not βMinor-globin. Such a mouse would be predicted to survive but be born with a mild β-thalassemia due to the decreased βMajor/βMinor ratio in its definitive erythroid cells. Preliminary results from the litters of F1 generation FH-tg mice indicate that such is indeed the case, i.e., that human FH functions as a βMajor-globin repressor in vivo.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».