Characterization of “<i>Brachyspira hampsonii</i>” clades I and II isolated from commercial swine in Western Canada
Notice bibliographique
Résumé
A novel Brachyspira emerged in 2009 and has since become a production-limiting pathogen of pigs in North America. The name “ Brachyspira hampsonii” has been proposed for this novel taxon. “ Brachyspira hampsonii” is divided into two phylogenetically distinct clades based on the sequence of the NADH-oxidase ( nox) gene, although the clinical disease associated with clades I and II is indistinguishable and phenotypic characteristics that discriminate the clades have not been determined. The objectives of the current study were to enhance the description of the provisional species “ B. hampsonii” with biochemical profiles and morphometric data from isolates affecting Canadian swine and to investigate potentially diagnostically informative characteristics for this emerging pathogen. Biochemical profiles of isolates from different commercial swine barns in Western Canada showed that biochemical profiles were insufficient to distinguish “ B. hampsonii” clades I and II from each other or from other pathogenic Brachyspira. Hippurate hydrolysis, previously reported as uniformly negative in “ B. hampsonii,” was variable among Canadian isolates. Spirochete dimensions and flagella numbers for “ B. hampsonii” overlapped with other Brachyspira species. Taken together, these results indicate that nox gene sequencing remains a preferred method for identification and discrimination of “ B. hampsonii” from other pig-associated Brachyspira spp.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
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Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
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Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».