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Enregistrement W2594630594 · doi:10.1038/srep43270

Robust Identification of Alzheimer’s Disease subtypes based on cortical atrophy patterns

2017· article· en· W2594630594 sur OpenAlexafffund
Jong-Yun Park, Han Kyu Na, Sung Soo Kim, Hyunwook Kim, Hee Jin Kim, Sang Won Seo, Duk L. Na, Cheol E. Han, Joon‐Kyung Seong, Michael D. Weiner, Paul Aisen, Ronald Petersen, Clifford R. Jack, William J. Jagust, John Q. Trojanowki, Arthur W. Toga, Laurel Beckett, Robert C. Green, Andrew J. Saykin, John C. Morris, Leslie M. Shaw, Enchi Liu, Tom Montine, Ronald G. Thomas, Michael Donohue, Sarah Walter, Devon Gessert, Tamie Sather, Gus Jiminez, Danielle Harvey, Matt A. Bernstein, Nick C. Fox, Paul M. Thompson, Norbert Schuff, Charles DeCarli, Bret Borowski, Jeff Gunter, Matthew L. Senjem, Prashanthi Vemuri, David Jones, Kejal Kantarci, Chad Ward, Robert A. Koeppe, Norm Foster, Eric M. Reiman, Kewei Chen, Susan Landau, Nigel J. Cairns, Erin Householder, Lisa Taylor Reinwald, Virginia Lee, Magdalena Korecka, Michal Figurski, Karen Crawford, Scott Neu, Tatiana M. Foroud, Steven G. Potkin, Li Shen, Kelley Faber, Sungeun Kim, Kwangsik Nho, Zaven Kachaturian, R.T. Frank, Peter J. Snyder, Susan Molchan, Jeffrey Kaye, Joseph F. Quinn, Betty Lind, Raina Carter, Sara Dolen, Lon S. Schneider, Sonia Pawluczyk, Mauricio Beccera, Liberty Teodoro, Bryan M. Spann, James B. Brewer, Helen Vanderswag, Adam Fleisher, Judith L. Heidebrink, Joanne Lord, Sara S. Mason, Colleen S. Albers, David S. Knopman, Kris Johnson, Rachelle S. Doody, Javier Villanueva Meyer, Munir Chowdhury, Susan Rountree, Mimi Dang, Yaakov Stern, Lawrence S. Honig, Karen L. Bell, Beau M. Ances, Maria Carroll, Sue Leon, Mark A. Mintun, Stacy Schneider, Angela Oliver, Daniel Marson, Randall Griffith, David Clark, David Geldmacher, John Brockington, Erik D. Roberson, Hillel Grossman, Effie Mitsis, Leyla de Toledo‐Morrell, Raj C. Shah, Ranjan Duara, Daniel Varon, Maria T. Greig, Peggy Roberts, Marilyn Albert, Chiadi Onyike, Daniel D’Agostino, Stephanie Kielb, James E. Galvin, Dana M. Pogorelec, Brittany Cerbone, Christina A. Michel, Henry Rusinek, Mony J. de Leon, Lidia Glodzik, Susan De Santi, P. Murali Doraiswamy, Jeffrey R. Petrella, Terence Z. Wong, Steven E. Arnold, Jason Karlawish, David A. Wolk, Charles D. Smith, Gregory A. Jicha, Peter Hardy, Partha Sinha, Elizabeth Oates, Gary Conrad, Oscar L. López, MaryAnn Oakley, Donna M. Simpson, Anton P. Porsteinsson, Bonnie S. Goldstein, Kim Martin, Kelly M. Makino, M. Saleem Ismail, Connie Brand, Ruth A. Mulnard, Gaby Thai, Catherine Mc Adams Ortiz, Kyle Womack, Dana Mathews, Mary Quiceno, Ramon Diaz Arrastia, Richard King, Myron Weiner, Kristen Martin Cook, Michael D. Devous, Allan I. Levey, James J. Lah, Janet S. Cellar, Jeffrey M. Burns, Heather S. Anderson, Russell H. Swerdlow, Liana G. Apostolova, Kathleen Tingus, Ellen Woo, Daniel Silverman, Po H. Lu, George Bartzokis, Neill R. Graff Radford, Francine Parfitt, Tracy Kendall, Heather Johnson, Martin R. Farlow, Ann Marie Hake, Brandy R. Matthews, Scott Herring, Cynthia Hunt, Christopher H. van Dyck, Richard E. Carson, Martha G. MacAvoy, Howard Chertkow, Howard Bergman, Chris Hosein, Sandra E. Black, Bojana Stefanovic, Curtis Caldwell, Ging‐Yuek Robin Hsiung, Howard Feldman, Benita Mudge, Michele Assaly, Dick Trost, Charles Bernick, Donna Munic, Diana Kerwin, Marek Marsel Mesulam, Kristine Lipowski, Chuang Wu, Nancy Johnson, Carl Sadowsky, Walter Martínez, Teresa Villena, Raymond Scott Turner, Kathleen Johnson, Brigid Reynolds, Reisa A. Sperling, Keith A. Johnson, Gad A. Marshall, Meghan Frey, Jerome A. Yesavage, Joy L. Taylor, Barton Lane, Allyson Rosen, Jared Tinklenberg, Marwan N. Sabbagh, Christine M. Belden, Sandra A. Jacobson, Sherye A. Sirrel, Neil W. Kowall, Ronald Killiany, Andrew E. Budson, Alexander Norbash, Patricia Lynn Johnson, Thomas O. Obisesan, Saba Wolday, Joanne Allard, Alan J. Lerner, Paula Ogrocki, Leon Hudson, Evan Fletcher, Owen Carmichael, John Olichney, Smita Kittur, Michael Borrie, T. Y. Lee, Robert Bartha, Sterling C. Johnson, Sanjay Asthana, Cynthia M. Carlsson, Adrian Preda, Dana Nguyen, Pierre N. Tariot, Stephanie Reeder, Vernice Bates, Horacio Capote, Michelle Rainka, Douglas W. Scharre, Maria Kataki, Anahita Adeli, Earl A. Zimmerman, Dzintra Celmins, Alice D. Brown, Godfrey D. Pearlson, Karen Blank, Karen Anderson, Robert B. Santulli, Tamar J. Kitzmiller, Eben S. Schwartz, Kaycee M. Sink, Jeff D. Williamson, Pradeep Garg, Franklin Watkins, Brian R. Ott, Henry Querfurth, Geoffrey Tremont, Stephen Salloway, Paul Malloy, Stephen Correia, Howard J. Rosen, Bruce L. Miller, Jacobo Mintzer, Kenneth Spicer, David Bachman, Elizabeth Finger, Stephen Pasternak, Irina Rachinsky, John Rogers, Andrew Kertesz, Nunzio Pomara, Raymundo Hernando, Antero Sarrael, Susan K. Schultz, Laura L. Boles Ponto, Hyungsub Shim, Karen E. Smith, Norman Relkin, Gloria Chaing, Lisa Raudin, Amanda Smith, Kristin Fargher, Balebail Ashok Raj

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueFunctional Brain Connectivity Studies
Établissements canadiensParkwood InstituteSunnybrook Health Science CentreMcGill UniversityJewish General Hospital
Organismes subventionnairesNational Institute on AgingNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringCanadian Institutes of Health ResearchGenentechIXICOH. Lundbeck A/SMinistry of Science ICT and Future PlanningServierEisaiMeso Scale DiagnosticsNational Research Foundation of KoreaNational Institutes of HealthMinistry of Science, ICT and Future PlanningNational Research FoundationNorthern California Institute for Research and EducationF. Hoffmann-La RocheInstitute for Information and Communications Technology PromotionPfizerBioClinicaBiogenUniversity of California, San DiegoTakeda Pharmaceuticals U.S.A.U.S. Department of DefenseEli Lilly and CompanyBristol-Myers SquibbAlzheimer's AssociationFoundation for the National Institutes of Health
Mots-clésSubtypingAtrophyNeuroimagingAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativePathologyNeuroscienceDiseaseAlzheimer's diseaseMedicineBiologyComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Accumulating evidence suggests that Alzheimer's disease (AD) is heterogenous and can be classified into several subtypes. Here, we propose a robust subtyping method for AD based on cortical atrophy patterns and graph theory. We calculated similarities between subjects in their atrophy patterns throughout the whole brain, and clustered subjects with similar atrophy patterns using the Louvain method for modular organization extraction. We applied our method to AD patients recruited at Samsung Medical Center and externally validated our method by using the AD Neuroimaging Initiative (ADNI) dataset. Our method categorized very mild AD into three clinically distinct subtypes with high reproducibility (>90%); the parietal-predominant (P), medial temporal-predominant (MT), and diffuse (D) atrophy subtype. The P subtype showed the worst clinical presentation throughout the cognitive domains, while the MT and D subtypes exhibited relatively mild presentation. The MT subtype revealed more impaired language and executive function compared to the D subtype.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,016
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Études des sciences et des technologies
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,291
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,016
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,076
Tête enseignante GPT0,293
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations83
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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