Registration pipeline for pulmonary free-breathing <sup>1</sup>H MRI ventilation measurements
Notice bibliographique
Résumé
Objectives: Our aim was to develop a clinically-practical and physiologically-relevant approach for regional structure-function measurements of the lung using Fourier decomposition of free-breathing pulmonary magnetic resonance imaging (FDMRI). Methods: Ten patients with chronic obstructive pulmonary disease provided written informed consent to a study protocol approved by Health Canada and completed pulmonary function tests, 1H/hyperpolarized noble gas and free-breathing pulmonary magnetic resonance imaging (MRI) during a single 2-hour visit. Free-breathing 1H MRI was simultaneously segmented using a multi-region coupled continuous max-flow approach by exploring primal/dual analysis and convex optimization techniques. The segmented free-breathing 1H MRI lung was registered using deformable registration approach that was developed using dual and convex optimization methods to compensate for respiratory/cardiac motion. Fourier decomposition of the co-registered lung was used to generate pulmonary functional information that was quantified as ventilation-defect-percent (VDP). The pipeline was implemented on a GPU for speed-up. Lung segmentation accuracy was measured by comparing algorithm and manual lung masks using Dice-similarity-coefficient (DSC). FD-VDP was compared to 3He-VDP using Pearson correlation coefficient and Bland-Altman analysis. The reproducibility of our algorithm was measured using coefficient of variation (CoV) and intraclass correlation coefficient (ICC) for DSC and FD-VDP. Results: The pipeline yielded a whole lung DSC of 95.7±1.7% and FD-VDP that were correlated with 3He-VDP (r = 0.81, p = 0.004). CoV (ICC) were 0.4% (0.98) and 4.1% (0.98) for whole lung DSC and FD-VDP, respectively. The proposed approach requires ~45 min for parallel implementation with minimal user interaction. Conclusion: The proposed approach provides a clinically-practical pipeline to generate regional pulmonary structure-function measurements using free-breathing pulmonary 1HMRI with promising potential for widespread clinical translation.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,006 | 0,004 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».