Registration pipeline for pulmonary free-breathing <sup>1</sup>H MRI ventilation measurements
Notice bibliographique
Résumé
Objectives: Our aim was to develop a clinically-practical and physiologically-relevant approach for regional structure-function measurements of the lung using Fourier decomposition of free-breathing pulmonary magnetic resonance imaging (FDMRI). Methods: Ten patients with chronic obstructive pulmonary disease provided written informed consent to a study protocol approved by Health Canada and completed pulmonary function tests, 1H/hyperpolarized noble gas and free-breathing pulmonary magnetic resonance imaging (MRI) during a single 2-hour visit. Free-breathing <sup>1</sup>H MRI was simultaneously segmented using a multi-region coupled continuous max-flow approach by exploring primal/dual analysis and convex optimization techniques. The segmented free-breathing 1H MRI lung was registered using deformable registration approach that was developed using dual and convex optimization methods to compensate for respiratory/cardiac motion. Fourier decomposition of the co-registered lung was used to generate pulmonary functional information that was quantified as ventilation-defect-percent (VDP). The pipeline was implemented on a GPU for speed-up. Lung segmentation accuracy was measured by comparing algorithm and manual lung masks using Dice-similarity-coefficient (DSC). FD-VDP was compared to <sup>3</sup>He-VDP using Pearson correlation coefficient and Bland-Altman analysis. The reproducibility of our algorithm was measured using coefficient of variation (CoV) and intraclass correlation coefficient (ICC) for DSC and FD-VDP. Results: The pipeline yielded a whole lung DSC of 95.7±1.7% and FD-VDP that were correlated with <sup>3</sup>He-VDP (r = 0.81, p = 0.004). CoV (ICC) were 0.4% (0.98) and 4.1% (0.98) for whole lung DSC and FD-VDP, respectively. The proposed approach requires ~45 min for parallel implementation with minimal user interaction. Conclusion: The proposed approach provides a clinically-practical pipeline to generate regional pulmonary structure-function measurements using free-breathing pulmonary <sup>1</sup>HMRI with promising potential for widespread clinical translation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».