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Enregistrement W2596303303 · doi:10.1161/atvb.32.suppl_1.a18

Abstract 18: Apo(a) Isoform Size Is Associated with Myocardial Infarction in a Study of an Admixed Population from the Central Valley of Costa Rica

2012· article· en· W2596303303 sur OpenAlexaff
Lance A. Bare, Charles M. Rowland, Marlys L. Koschinsky, Michael B. Boffa, Carmen H. Tong, André R. Arellano, Joseph J. Catanese, Dov Shiffman, James J. Devlin, Hannia Campos

Notice bibliographique

RevueArteriosclerosis Thrombosis and Vascular Biology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLipoproteins and Cardiovascular Health
Établissements canadiensUniversity of Windsor
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGene isoformApolipoprotein BLipoprotein(a)PopulationWestern blotLipoproteinSingle-nucleotide polymorphismAlleleBiologyInternal medicineGeneticsGenotypeMolecular biologyGeneDemographyMedicineEndocrinologyCholesterol

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objective: Lipoprotein(a) [Lp(a)] particles contain a single apolipoprotein(a) [apo(a)] molecule. Both plasma Lp(a) levels and apo(a) isoform size are associated with myocardial infarction (MI). We asked whether Lp(a) level and apo(a) isoform size are independently associated with MI in an admixed population (African, Amer-indian, Southern European) from the Central Valley of Costa Rica. Methods: Apo(a) isoform size is determined by the number of kringle IV type 2 (KIV-2) repeats in the protein, and when two different alleles are expressed, the smaller isoform is typically expressed at higher levels. We assessed isoform size by Western blot and Lp(a) levels by immunoturbidometric assay in randomly selected MI cases and population-based controls from a study of 4186 Central Valley Costa Ricans. Association with MI was assessed using logistic regression models that included Lp(a) level and the size of the smaller isoform as explanatory variables. A model including adjustment for local ethnicity determined by principal component analysis of 41 SNPs within 410 kilobases of the gene encoding apo(a) [LPA] was performed on a subset of subjects with genotypes for all 41 SNPs. Results: For 433 subjects, for whom one or both apo(a) isoform sizes were determined by Western blot, we found that both size of the smaller expressed apo(a) isoform and Lp(a) level were associated with MI: OR=1.48 (p= 0.021) per decrease of 5 KIV-2 repeats and OR=1.27 (p=2.8x10-5) per 10 mg/dL increase in Lp(a). In multivariable analysis, the size of the smaller apo(a) isoform was associated with MI after adjustment for Lp(a) levels (OR=1.29; p= 0.034). Similarly, Lp(a) levels remained associated with MI after adjustment for the size of the smaller apo(a) isoform (OR=1.19; p=0.005). Further adjustment for local ethnicity did not appreciably change the association of the smaller apo(a) isoform with MI (OR= 1.38;p= 0.056) or the association of Lp(a) levels with MI (OR=1.11, p=0.18). Apo(a) isoform size was strongly associated with Lp(a) levels (9.6 mg/dL increase in Lp(a) per decrease of 5 KIV-2 repeats (p=1.7x10-24). Conclusion: Apo(a) isoform size is associated with MI after adjustment for Lp(a) in a population from the Central Valley of Costa Rica. The hypothesis that apo(a) isoform size is associated with MI independent of Lp(a) levels appears worthy of further study.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,018
Score d'incertitude au seuil0,035

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,290
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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