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Enregistrement W2596473688 · doi:10.1093/biolreprod/78.s1.289a

Characterization of DER1-Like Domain Family, Member 1 (DERL1) and its Expression in Bovine Corpus Luteum.

2008· article· en· W2596473688 sur OpenAlexaff
Kalidou Ndiaye, Jacques G. Lussier, Joy L. Pate

Notice bibliographique

RevueBiology of Reproduction · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdipose Tissue and Metabolism
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyEndoplasmic reticulumCorpus luteumMessenger RNAComplementary DNAMolecular biologyTransmembrane domainNorthern blotER retentionProtein degradationCell biologyBiochemistryAmino acidGeneHormoneMutant

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The endoplasmic reticulum (ER) is a major site of protein synthesis and facilitates the folding and assembly of newly synthesized secretory and membrane proteins. Misfolded proteins are targeted for degradation in a process that involves ubiquitination and retro-translocation across the ER membrane and destroyed at the proteasome. The Degradation in Endoplasmic Reticulum1 (DER1)-like domain family, member 1 (DERL1 also called DERLIN1) has been reported to be an important factor involved in the retro-translocation and degradation of a subset of misfolded proteins from the ER. We characterized a 2617 bp cDNA from a phage cDNA library generated from bovine granulosa cell mRNA that corresponded to bovine DERL1 mRNA. This mRNA is translated into a protein of about 28.8 kDa that showed 94% identity with the human DERL1, and 92, 86, and 82% identity with the mouse, chicken, and frog proteins, respectively. Amino acid analysis also showed that DERL1 presents four putative transmembrane domains, a characteristic of membrane protein. Two major transcripts of 3 kb and 2.6 kb that correspond to DERL1 were detected by Northern blot analysis, and showed variations in the steady-state concentrations among tissues. DERL1 mRNA was observed in all tissues analyzed including the uterus and the CL. In the CL, DERL1 mRNA expression was greatest early in the estrous cycle (day 5), intermediate in midcycle (day 11, p = 0.064), and lowest in late cycle (day 18, p < 0.05). Injection of PGF2α during the midcycle induced a transient increase of DERL1 expression at 8 hr post PGF2α (p = 0.065) followed by a decrease at 12 hr post PGF2α (p = 0.081) compared to D11 CL. Additionally, expression of DERL1 mRNA was significantly greater at 8 hr post PGF2α than at 1 hr and at 12 hr (p < 0.05). However, no difference was observed in the steady-state concentrations of DERL1 mRNA in the CL of pregnant cows as compared to non-pregnant cows (p > 0.1). Western blot analysis demonstrated the presence of DERL1 protein in the bovine CL from days 5, 11, and 18 of the estrous cycle. The ubiquitous, yet variable expression of DERL1, combined with the highly conserved protein among species, suggest a fundamental function of DERL1 within cells, especially from transient tissues, such as the CL. DERL1 might be involved in the function of the early and midcycle functional CL by eliminating misfolded proteins, therefore, participating in luteal cell survival.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,274
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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