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Enregistrement W2597720589 · doi:10.1093/hmg/ddx122

Scribble1 plays an important role in the pathogenesis of neural tube defects through its mediating effect of Par-3 and Vangl1/2 localization

2017· article· en· W2597720589 sur OpenAlexaff
Fares Kharfallah, Marie Claude Guyot, Redouane Allache, Elisa Merello, Patrizia De Marco, Graziella Di Cristo, Valeria Capra, Zoha Kibar

Notice bibliographique

RevueHuman Molecular Genetics · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHippo pathway signaling and YAP/TAZ
Établissements canadiensUniversité de MontréalCentre Hospitalier Universitaire Sainte-Justine
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyGene knockdownPathogenesisCell polarityMutantMissense mutationCell biologyMutationGeneticsCellMolecular biologyGeneImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Scribble1 (Scrib1) is a tumor suppressor gene that has long been established as an essential component of apicobasal polarity (ABP). In mouse models, mutations in Scrib1 cause a severe form of neural tube defects (NTDs) as a result of a defective planar cell polarity (PCP) signaling. In this study, we dissected the role of Scrib1 in the pathogenesis of NTDs in its mouse mutant Circletail (Crc), in cell lines and in a human NTD cohort. While there were no obvious defects in ABP in the Scrib1Crc/Crc neuroepihelial cells, we identified an abnormal localization of the apical protein Par-3 and of the PCP protein Vangl2. These results were concordant with those obtained following a partial knockdown of Scrib1 in MDCK II cells. Par-3 was able to rescue the localization defect of Vangl1 (paralog of Vangl2) caused by partial knockdown of Scrib1 suggesting that Scrib1 exerts its effect on Vangl1 localization indirectly through Par-3. This conclusion is supported by our findings of an apical enrichment of Vangl1 following a partial knockdown of Par-3. Re-sequencing analysis of SCRIB1 in 473 NTD patients led to the identification of 5 rare heterozygous missense mutations that were predicted to be pathogenic. Two of these mutations, p.Gly263Ser and p.Gln808His, and 2 mouse NTD mutations, p.Ile285Lys and p.Glu814Gly, affected Scrib1 membrane localization and its modulating role of Par-3 and Vangl1 localization. Our study demonstrates an important role of Scrib1 in the pathogenesis of NTDs through its mediating effect of Par-3 and Vangl1/2 localization and most likely independently of ABP.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,647

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,274
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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