Molecular characteristics of VP2 gene from wild-type infectious bursal disease viruses (IBDVs) in Saudi Arabia
Notice bibliographique
Résumé
Infectious bursal disease (IBD) is caused by a virus related to the family Birnaviridae. The virus is a worldwide pathogen and causes immunosuppression and great losses in broiler flocks. In this study, molecular characterization of two Saudi Arabian IBDVs (IBD01/14/SA and IBD02/14/SA) was carried out by reverse transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR) and partial sequence of hypervariable region of VP2 gene. Nucleotide sequences of 740-bp PCR product of the Saudi Arabian isolates were compared with the corresponding nucleotide sequence of 56 reported IBDVs representing different pathotypes from different continents. Phylogenetic analysis showed that the Saudi Arabian isolates were split from the tree to form a distinguished cluster with the Canadian IBDVs and 586/USA field viruses. Deduced amino sequences from both strains were found to share the amino acid substitutions of the standard very virulent (vv) strains. The Saudi Arabian strains showed unique amino acid substitutions 254N and 359K and exhibited a modified antigenic profile. The deduced amino acid sequence and antigenic profile of both wild-type Saudi Arabian strains showed high similarity to the IBDI+ vaccines; hence, the Saudi Arabian strains might be more useful for protecting chickens against overt clinical signs and mortalities.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».