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Enregistrement W2598218480 · doi:10.56808/2985-1130.2810

Molecular characteristics of VP2 gene from wild-type infectious bursal disease viruses (IBDVs) in Saudi Arabia

2017· article· en· W2598218480 sur OpenAlexaboutno aff
Mahmoud H. A. Mohamed, Mahmoud M. Ismail, Ibrahim M. El-Sabagh, Abdul-Rahman S. Al-Ankari

Notice bibliographique

RevueThe Thai Journal of Veterinary Medicine · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueVirology and Viral Diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesKing Faisal University
Mots-clésInfectious bursal diseaseHypervariable regionBiologyVirologyPhylogenetic treeNucleic acid sequenceGeneVirusSequence analysisPolymerase chain reactionAmino acidPeptide sequenceVirulenceGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Infectious bursal disease (IBD) is caused by a virus related to the family Birnaviridae. The virus is a worldwide pathogen and causes immunosuppression and great losses in broiler flocks. In this study, molecular characterization of two Saudi Arabian IBDVs (IBD01/14/SA and IBD02/14/SA) was carried out by reverse transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR) and partial sequence of hypervariable region of VP2 gene. Nucleotide sequences of 740-bp PCR product of the Saudi Arabian isolates were compared with the corresponding nucleotide sequence of 56 reported IBDVs representing different pathotypes from different continents. Phylogenetic analysis showed that the Saudi Arabian isolates were split from the tree to form a distinguished cluster with the Canadian IBDVs and 586/USA field viruses. Deduced amino sequences from both strains were found to share the amino acid substitutions of the standard very virulent (vv) strains. The Saudi Arabian strains showed unique amino acid substitutions 254N and 359K and exhibited a modified antigenic profile. The deduced amino acid sequence and antigenic profile of both wild-type Saudi Arabian strains showed high similarity to the IBDI+ vaccines; hence, the Saudi Arabian strains might be more useful for protecting chickens against overt clinical signs and mortalities.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,053
Tête enseignante GPT0,345
Écart entre enseignants0,292 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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