Effect of fixation time on breast biomarker expression: a controlled study using cell line-derived xenografted (CDX) tumours
Notice bibliographique
Résumé
Aims Altering the length of time specimens are placed in fixative without compromising analytical testing accuracy is a continuous challenge in the anatomical pathology lab. The aim of this study was to determine under controlled conditions the effects of variable fixation time on breast biomarker expression in human breast cancer cell line-derived xenografted (CDX) tumours. Methods CDX tumours using strong oestrogen receptor (ER)-positive, Her2-negative (MCF7) and weak ER-positive, Her2 equivocal (T47D) breast cancer cell lines were fixed for various times ranging from 1 to 336 hours in 10% neutral buffered formalin. CDX tumours were processed according to routine biomarker testing protocols and stained for ER and Her2 immunohistochemistry (IHC) and processed for HER 2 fluorescence in situ hybridisation (FISH). The tumours were evaluated using Allred scoring for ER and current ASCO/CAP guidelines for Her2, and by objective cell counting methodology. Results No differences were found in expression of ER in either MCF7 or T47D CDX tumours under variable fixation. T47D tumours displayed equivocal Her2 staining when fixed for 24 hours, but fixation for ≤8 hours resulted in consistently negative staining while tumours fixed for >72 hours demonstrated consistent equivocal staining (p<0.01). Cell counting assays revealed only a significant increase in sensitivity in tumours fixed for >72 hours (p<0.01). As expected, FISH results were unaffected by variable fixation. Conclusions Neither shortened nor prolonged fixation affects ER expression, consistent with previous findings. In equivocal Her2-expressing tumours, however, increasing fixation increased the sensitivity of Her2 IHC reporting while not affecting FISH.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».