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Enregistrement W2600935377 · doi:10.1126/scisignal.aah5756

Structural basis for chemokine recognition by a G protein–coupled receptor and implications for receptor activation

2017· article· en· W2600935377 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueScience Signaling · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueReceptor Mechanisms and Signaling
Établissements canadiensUniversité de MontréalCentre Hospitalier Universitaire Sainte-Justine
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesNational Cancer InstituteNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of Health
Mots-clésChemokine receptorReceptorCCR1Cell biologyChemokineG protein-coupled receptorC-C chemokine receptor type 7BiologyCCL21C-C chemokine receptor type 6Chemokine receptor CCR5Computational biologyChemistrySignal transductionBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Chemokines orchestrate cell migration for development, immune surveillance, and disease by binding to cell surface heterotrimeric guanine nucleotide-binding protein (G protein)-coupled receptors (GPCRs). The array of interactions between the nearly 50 chemokines and their 20 GPCR targets generates an extensive signaling network to which promiscuity and biased agonism add further complexity. The receptor CXCR4 recognizes both monomeric and dimeric forms of the chemokine CXCL12, which is a distinct example of ligand bias in the chemokine family. We demonstrated that a constitutively monomeric CXCL12 variant reproduced the G protein-dependent and β-arrestin-dependent responses that are associated with normal CXCR4 signaling and lead to cell migration. In addition, monomeric CXCL12 made specific contacts with CXCR4 that are not present in the structure of the receptor in complex with a dimeric form of CXCL12, a biased agonist that stimulates only G protein-dependent signaling. We produced an experimentally validated model of an agonist-bound chemokine receptor that merged a nuclear magnetic resonance-based structure of monomeric CXCL12 bound to the amino terminus of CXCR4 with a crystal structure of the transmembrane domains of CXCR4. The large CXCL12:CXCR4 protein-protein interface revealed by this structure identified previously uncharacterized functional interactions that fall outside of the classical "two-site model" for chemokine-receptor recognition. Our model suggests a mechanistic hypothesis for how interactions on the extracellular face of the receptor may stimulate the conformational changes required for chemokine receptor-mediated signal transduction.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesÉtudes des sciences et des technologies
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,024
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,290
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle