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Enregistrement W2601522016 · doi:10.2337/db16-1329

A Low-Frequency Inactivating <i>AKT2</i> Variant Enriched in the Finnish Population Is Associated With Fasting Insulin Levels and Type 2 Diabetes Risk

2017· article· en· W2601522016 sur OpenAlexafffund
Alisa K. Manning, Heather M. Highland, Jessica A. Gasser, Xueling Sim, Taru Tukiainen, Pierre Fontanillas, Niels Grarup, Manuel A. Rivas, Anubha Mahajan, Adam E. Locke, Pablo Cingolani, Tune H. Pers, Ana Viñuela, Andrew Brown, Ying Wu, Jason Flannick, Christian Fuchsberger, Eric R. Gamazon, Kyle J. Gaulton, Hae Kyung Im, Tanya M. Teslovich, Thomas W. Blackwell, Jette Bork‐Jensen, Noël P. Burtt, Yuhui Chen, Todd J. Green, Christopher Hartl, Hyun Min Kang, Ashish Kumar, Claes Ladenvall, Clement Ma, Loukas Moutsianas, Richard D. Pearson, John R. B. Perry, Nigel W. Rayner, Neil R. Robertson, Laura J. Scott, Martijn van de Bunt, Johan G. Eriksson, Antti Jula, Seppo Koskinen, Terho Lehtimäki, Aarno Palotie, Olli T. Raitakari, Suzanne B.R. Jacobs, Jennifer Wessel, Audrey Y. Chu, Robert A. Scott, Mark O. Goodarzi, Christine Blancher, Gemma Buck, David Buck, Peter S. Chines, Stacey Gabriel, Anette P. Gjesing, Christopher J. Groves, Mette Hollensted, Jeroen R. Huyghe, Anne Jackson, Goo Jun, Johanne Marie Justesen, Massimo Mangino, Jacquelyn Murphy, Matt J. Neville, Robert C. Onofrio, Kerrin S. Small, Heather M. Stringham, Joseph Trakalo, Eric Banks, Jason Carey, Mauricio O. Carneiro, Mark A. DePristo, Yossi Farjoun, Timothy R. Fennell, Jacqueline I. Goldstein, George Grant, Martin Hrabě de Angelis, Jared Maguire, Benjamin M. Neale, Ryan Poplin, Shaun Purcell, Thomas Schwarzmayr, Khalid Shakir, Joshua D. Smith, Tim M. Strom, Thomas Wieland, Jaana Lindström, Ivan Brandslund, Cramer Christensen, Gabriela Surdulescu, Timo A. Lakka, Alex S. F. Doney, Peter M. Nilsson, Nicholas J. Wareham, Claudia Langenberg, Tibor V. Varga, Paul W. Franks, Olov Rolandsson, Anders H. Rosengren, Vidya S. Farook, Farook Thameem, Sobha Puppala, Satish Kumar, Donna M. Lehman, Christopher P. Jenkinson, Joanne E. Curran, Daniel E. Hale, Sharon P. Fowler, Rector Arya, Ralph A. DeFronzo, Hanna E. Abboud, Ann‐Christine Syvänen, Maggie C. Y. Ng, Donald W. Bowden, Barry I. Freedman, Tõnu Esko, Reedik Mägi, Lili Milani, Evelin Mihailov, Andres Metspalu, Narisu Narisu, Leena Kinnunen, Lori L. Bonnycastle, Amy J. Swift, Dorota Pasko, Andrew R. Wood, João Fadista, Toni I. Pollin, Nir Barzilai, Gil Atzmon, Benjamin Gläser, Barbara Thorand, Konstantin Strauch, Annette Peters, Michael Roden, Martina Müller‐Nurasyid, Liming Liang, Jennifer Kriebel, Thomas Illig, Harald Grallert, Christian Gieger, Christa Meisinger, Lars Lannfelt, Solomon K. Musani, Michael Griswold, Herman A. Taylor, Gregory Wilson, Adolfo Correa, Heikki Oksa, William R. Scott, Uzma Afzal, Marie Loh, John C. Chambers, Jobanpreet Sehmi, Jaspal S. Kooner, Benjamin Lehne, Yoon Shin Cho, Jong‐Young Lee, Bok‐Ghee Han, Annemari Käräjämäki, Qibin Qi, Lu Qi, Jinyan Huang, Frank B. Hu, Olle Melander, Marju Orho‐Melander, Jennifer E. Below, David Aguilar, Tien Yin Wong, Jianjun Liu, Chiea Chuen Khor, Kee Seng Chia, Wei Yen Lim, Ching‐Yu Cheng, Edmund Chan, E Shyong Tai, Tin Aung, Allan Linneberg, Bo Isomaa, Thomas Meitinger, Liisa Hakaste, Jasmina Kravić, Marit E. Jørgensen, Torsten Lauritzen, Panos Deloukas, Kathleen Stirrups, Katharine R. Owen, Timothy M. Frayling, Stephen O’Rahilly, Mark Walker, J Lévy, Dylan Hodgkiss, Andrew T. Hattersley, Teemu Kuulasmaa, Alena Stančáková, Inês Barroso, Dwaipayan Bharadwaj, Juliana C.N. Chan, Giriraj R. Chandak, Mark J. Daly, Peter Donnelly, Shah B. Ebrahim, Paul Elliott, Tasha E. Fingerlin, Philippe Froguel, Cheng Hu, Weiping Jia, Ronald C.W., Gilean McVean, Taesung Park, Dorairaj Prabhakaran, Manjinder S. Sandhu, James Scott, Robert Sladek, Nikhil Tandon, Yik Ying Teo, Eleftheria Zeggini, Richard M. Watanabe, Heikki A. Koistinen, Y. Antero Kesäniemi, Matti Uusitupa, Timothy D. Spector, Veikko Salomaa, Rainer Rauramaa, Inga Prokopenko, Andrew D. Morris, Richard N. Bergman, Francis S. Collins, Lars Lind, Erik Ingelsson, Jaakko Tuomilehto, Fredrik Karpe, Leif Groop, Torben Jørgensen, Torben Hansen, Oluf Pedersen, Johanna Kuusisto, Gonçalo R. Abecasis, Graeme I. Bell, John Blangero, Nancy J. Cox, Ravindranath Duggirala, Mark Seielstad, James G. Wilson, Josée Dupuis, Samuli Ripatti, Craig L. Hanis, José C. Florez, Karen L. Mohlke, James B. Meigs, Markku Laakso, Andrew P. Morris, Michael Boehnke, David Altshuler, Mark I. McCarthy, Anna L. Gloyn, Cecilia M. Lindgren

Notice bibliographique

RevueDiabetes · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiovascular Function and Risk Factors
Établissements canadiensMcGill UniversityMcGill University and Génome Québec Innovation Centre
Organismes subventionnairesNational Institute on Drug AbuseNational Heart, Lung, and Blood InstituteMünchner Zentrum für GesundheitswissenschaftenBiomedical Research CouncilNIH Office of the DirectorNational Medical Research CouncilMRC-PHE Centre for Environment and HealthNovo Nordisk FondenNational Institute of General Medical SciencesCenters for Disease Control and PreventionDiabetesliittoSydäntutkimussäätiöEmil Aaltosen SäätiöAugustinus FondenNational Human Genome Research InstituteUniversity of Texas Health Science Center at HoustonDanmarks Frie ForskningsfondMedical Research CouncilTartu ÜlikoolVetenskapsrådetKuopion Yliopistollinen SairaalaJuho Vainion SäätiöNovo NordiskHjärt-LungfondenSuomen KulttuurirahastoNational Institute on AgingHelsefondenBritish Heart FoundationBundesministerium für Bildung und ForschungHelmholtz Zentrum MünchenKelaSamfundet FolkhälsanPäivikki ja Sakari Sohlbergin SäätiöNational Institute of Mental HealthEesti TeadusagentuurSteno Diabetes Center CopenhagenNational Institute for Health Research Health Protection Research UnitEuropean CommissionNational Research FoundationFolkhälsanin TutkimussäätiöNational Institute for Health and Care ResearchSundhed og Sygdom, Det Frie ForskningsrådJohns Hopkins UniversityImperial College LondonNational Institutes of HealthSihtasutus ArchimedesNational University of SingaporeNational Cancer InstituteLundbeckfondenFoundation for Cardiovascular ResearchFinska LäkaresällskapetAtlantic Canada Opportunities AgencyNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesHelsingin ja Uudenmaan SairaanhoitopiiriLunds UniversitetKing's College LondonJalmari ja Rauha Ahokkaan SäätiöDiabetestutkimussäätiöKorea Centers for Disease Control and PreventionImperial College Healthcare NHS TrustWellcome TrustSwiss Institute of BioinformaticsHjerteforeningenTekesWellcomeAmerican Diabetes Association
Mots-clésType 2 diabetesMedicineInternal medicineDiabetes mellitusEndocrinologyInsulinPopulationEnvironmental health

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To identify novel coding association signals and facilitate characterization of mechanisms influencing glycemic traits and type 2 diabetes risk, we analyzed 109,215 variants derived from exome array genotyping together with an additional 390,225 variants from exome sequence in up to 39,339 normoglycemic individuals from five ancestry groups. We identified a novel association between the coding variant (p.Pro50Thr) in AKT2 and fasting plasma insulin (FI), a gene in which rare fully penetrant mutations are causal for monogenic glycemic disorders. The low-frequency allele is associated with a 12% increase in FI levels. This variant is present at 1.1% frequency in Finns but virtually absent in individuals from other ancestries. Carriers of the FI-increasing allele had increased 2-h insulin values, decreased insulin sensitivity, and increased risk of type 2 diabetes (odds ratio 1.05). In cellular studies, the AKT2-Thr50 protein exhibited a partial loss of function. We extend the allelic spectrum for coding variants in AKT2 associated with disorders of glucose homeostasis and demonstrate bidirectional effects of variants within the pleckstrin homology domain of AKT2.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,450

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations52
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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