Perfil fenotípico e genotípico da resistência aos antimicrobianos em "Klebsiella pneumoniae", "Salmonella enterica" e estafilococos coagulase-negativa
Notice bibliographique
Résumé
A resistencia antimicrobiana e um problema comumente encontrado em medicina humana e veterinaria. Agentes como Klebsiella Salmonella e estafilococos coagulase-negativa (ECN) sao alvo de pesquisas na deteccao e identificacao de genes de resistencia aos antimicrobianos. O presente estudo visou estabelecer o perfil de resistencia fenotipico e genotipico em: (i) amostras de S. enterica isoladas de animais domesticos e pacientes humanos no Estado de Sao Paulo; (ii) amostras de K. pneumoniae isoladas de fezes e leite de bovinos leiteiros em rebanhos Brasileiros; e (iii) amostras de ECN isoladas de leite bovino de rebanhos leiteiros Canadenses. Ainda, estudar associacoes entre os respectivos perfis e a origem dos isolados, os diferentes sistemas de producao, os estratos de celulas somaticas do tanque, e estabelecer associacoes entre a utilizacao de antimicrobianos e resistencia aos mesmos em isolados de ECN. Neste projeto, 166 isolados de K. pneumoniae oriundos de 24 propriedades leiteiras, 153 S. enterica oriundos de carcacas de frangos de corte e pacientes humanos e 1.859 amostras de ECN isoladas de leite de vacas em rebanhos Canadenses foram submetidos ao antibiograma e a deteccao molecular de genes de resistencia, associados ao respectivo perfil. Ainda, foram obtidas associacoes dos perfis de resistencia com a origem dos isolados. No caso de S. enterica, resistencia foi comumente observada para estreptomicina, tetraciclina, combinacao de sulfametoxazol / trimetoprim e amoxicilina. Os genes mais comumente encontrados de acordo com estes perfis foram aadA, tetC, sul1 e blactx-m, sendo este, para nosso conhecimento, o primeiro relato do gene qnrB em S. enterica isolada de humanos no Brasil. Os perfis observados foram distintos em isolados humanos e animais corroborando com estudos previos que demonstram diferentes mecanismos de resistencia em medicina humana e veterinaria, com o primeiro demonstrando maiores proporcoes de resistencia para diversas drogas. Nos isolados de K. pneumoniae, foi detectada uma associacao entre a origem do isolado (leite ou fezes) e a resistencia para estreptomicina, cloranfenicol, tetraciclina e sulfametoxazol. Perfis multirresistentes foram observados apenas em isolados de origem clinica (leite mastitico). Os genes comumente encontrados incluiram tetD, tetB e sul2. Tratando-se de isolados de ECN, resistencia as sulfonamidas foi o perfil mais comumente observado (18,65%) seguido pela penicilina, tetraciclina e eritromicina (11,95%, 11,29% e 6,5% respectivamente). Entre as Provincias Canadenses, Alberta apresentou a menor prevalencia de resistencia as sulfonamidas, apesar de a prevalencia de isolados multirresistentes ter sido constante nas diferentes Provincias. Nos diferentes tipos de instalacoes, isolados de tie-stalls tiveram maior chance de serem multirresistentes em comparacao com isolados de free-stall. A utilizacao de antimicrobianos foi associada a presenca de isolados multirresistentes, especialmente no caso do cloranfenicol e macrolideos. Os genes blaZ e mecA (beta-lactâmicos), str e aadE (aminoglicosideos), ermA e ermC (macrolideos), tetK e tetL (tetraciclinas) foram os mais comumente observados. Abstract
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».