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Enregistrement W26031136 · doi:10.1096/fasebj.20.4.a112-b

Expression and characterization of soluble transferrin receptor in BHK cells: effect of mutations at the three asparagine glycosylation sites

2006· article· en· W26031136 sur OpenAlexaff
Shaina L. Byrne, Rachael Leverence, Igor A. Kaltashov, Joshua S. Klein, Anthony M. Giannetti, Valerie C. Smith, Ross T. A. MacGillivray, Anne B. Mason

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueIron Metabolism and Disorders
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesU.S. Public Health Service
Mots-clésTransferrin receptorMutantTransferrinChemistryGlycosylationBaby hamster kidney cellAsparagineEndocytosisBiochemistryMutationReceptorPoint mutationMolecular biologyCellAmino acidBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Transferrin (TF) is a bilobal iron transport protein that specifically binds to receptors (TFR) on the cell surface and delivers iron to cells by a process involving receptor mediated endocytosis and a pH change. The TF binding portion of the TFR (residues 121–760) containing a hexa‐His tag has been expressed by baby hamster kidney (BHK) cells as a secreted entity. TFR has three Asn linked glycosylation sites at position 251, 317 and 727. To prevent glycosylation at each site, three single point mutants in which Asn is mutated to Asp have been constructed. For wild type (WT), N251D and N727D TFR a maximum of 40 mg/L is produced, whereas maximum production of the N317D TFR mutant is considerably lower. Characterization of the WT and the mutant TFR constructs includes analysis by mass spectrometry and estimation of binding constants for interaction with diferric TF, monoferric TF C‐lobe (Fe C ‐TF) and a Fe C ‐TF mutant. Additionally the rate of iron release from Fe C ‐TF in the presence and absence of the various TFR constructs has been determined. The N317D TFR mutant binds more weakly to Fe C ‐TF and shows a reduced ability to stimulate the release of iron from Fe C ‐TF at pH 5.6 compared to WT TFR and the other two mutants. A structural basis for these findings is presented. This work was supported by USPHS Grant R01 DK 21739 (ABM) and R01 GM061666 (IAK).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,232
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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