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Enregistrement W2604244818 · doi:10.1158/1557-3125.dnarepair16-b19

Abstract B19: The ATR inhibitor, AZD6738, synergizes with other DNA damage response inhibitors and genotoxic drugs in pancreatic ductal adenocarcinoma cell lines: Opportunities for new therapeutic combinations

2017· article· en· W2604244818 sur OpenAlexaboutno aff
Yann Wallez, Siang‐Boon Koh, Venkata Sai Vivek Bhogadi, Alan Lau, Frances M. Richards, Duncan I. Jodrell

Notice bibliographique

RevueMolecular Cancer Research · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA Repair Mechanisms
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCancer researchDNA damagePARP1PARP inhibitorCHEK1BiologyPancreatic cancerDNA repairOlaparibCell cycle checkpointCancerCell cycleDNAPoly ADP ribose polymeraseGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Mutations in oncogenes, tumor suppressor and DNA damage response (DDR) mediator genes drive or permit malignant transformation but also increase endogenous replication stress. The serine/threonine kinase ATR plays a critical role in safeguarding genome integrity from such replication stress and several studies have demonstrated the increased reliance of cancer cells on ATR function. We investigated the therapeutic opportunities for the ATR inhibitor, AZD6738, in combination with DNA damaging or DDR-targeted agents, in the context of pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC). We evaluated four DNA-damaging agents (gemcitabine, 5-fluorouracil, oxaliplatin, SN38 (the active metabolite of irinotecan)) and three DDR-targeted agents (Wee1 inhibitor (AZD1775), Chk1 inhibitor (MK8776), PARP inhibitor (AZD2281)), each in combination with AZD6738 at multiple concentrations. Efficacy of these combinations was tested in growth inhibition assays in vitro, using a panel of cell lines in order to capture some of the genetic heterogeneity observed in PDAC: two human cell lines and four lines from the KrasG12D; Trp53R172H; Pdx-Cre (KPC) mouse. Synergistic growth inhibition was identified applying both Bliss Independence and Loewe models, using Combenefit software. All the KPC mouse cell lines were sensitive to AZD6738 as a single agent, with GI50 ranging from 346 to 566 nM. MIA PaCa-2 were sensitive to AZD6738, achieving >90% growth inhibition, with GI50 of 2.2 μM. PANC-1 cells were less sensitive, with GI50 21 μM and achieving only ~60% GI, at the highest concentration tested. PANC-1 cells are also less sensitive to gemcitabine than the other cell lines. Synergy was detected in most of the cell lines, with each of the seven drug combinations tested. The combinations of AZD6738 with gemcitabine and with oxaliplatin showed synergy in all cell lines tested. We next investigated scheduling of the gemcitabine/ATRi combination, at the specific GI50 concentrations for each cell line, using kinetic live-cell imaging assays. Concurrent treatment of gemcitabine/ATRi for 16h proved to be most effective, almost completely inhibiting cell growth for more than three days after washout. Sequential treatment (irrespective of the order) or shorter pulses (8h) were less effective. Maintaining ATRi after gemcitabine washout further enhanced growth inhibition for most cell lines. Mechanistically, ATRi impaired Chk1 activation (p-Ser345) and, in combination with gemcitabine, strongly potentiated DNA damage (gamma H2AX). Maintaining ATRi after gemcitabine washout helped to sustain the level of DNA damage. In vivo studies are underway to determine whether the gemcitabine/ATRi combination enhances efficacy compared to gemcitabine alone. The ATRi/oxaliplatin combination is also being investigated in vitro and in vivo using similar methods. Several genes have been described in the literature to increase the reliance on ATR functions when altered. Mining two published datasets (TCGA, 186 samples and UTSW, Nat. Commun. 2015, 109 samples) we have investigated the frequencies at which 21 of these genes were altered in human PDAC. Overall ~95% of PDAC samples exhibit at least one (9% only one, 28% two and 57% three or more) genetic alteration likely to sensitize to ATRi, potentially improving the therapeutic index of combination approaches. Thus, combinations including ATRi merit further evaluation as they have the potential to be effective in the treatment of patients with PDAC. Citation Format: Yann Wallez, Siang-Boon Koh, Venkata Sai Vivek Bhogadi, Alan Lau, Frances M. Richards, Duncan I. Jodrell. The ATR inhibitor, AZD6738, synergizes with other DNA damage response inhibitors and genotoxic drugs in pancreatic ductal adenocarcinoma cell lines: Opportunities for new therapeutic combinations [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference on DNA Repair: Tumor Development and Therapeutic Response; 2016 Nov 2-5; Montreal, QC, Canada. Philadelphia (PA): AACR; Mol Cancer Res 2017;15(4_Suppl):Abstract nr B19.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,025
Score d'incertitude au seuil0,783

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,054
Tête enseignante GPT0,333
Écart entre enseignants0,279 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
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