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Enregistrement W2604568423 · doi:10.1002/jrsm.1287

Machine learning for identifying Randomized Controlled Trials: An evaluation and practitioner's guide

2018· article· en· W2604568423 sur OpenAlexfundno aff
Iain Marshall, Anna H Noel-Storr, Joël Kuiper, James Thomas, Byron Wallace

Notice bibliographique

RevueResearch Synthesis Methods · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueMachine Learning in Healthcare
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesU.S. National Library of MedicineAgency for Healthcare Research and QualityNational Institutes of HealthNational Cancer InstituteMedical Research CouncilMcMaster University
Mots-clésComputer scienceMachine learningArtificial intelligenceRandomized controlled trialWorkflowConvolutional neural networkSupport vector machineSystematic reviewSensitivity (control systems)Data miningMEDLINEMedicineDatabase

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Machine learning (ML) algorithms have proven highly accurate for identifying Randomized Controlled Trials (RCTs) but are not used much in practice, in part because the best way to make use of the technology in a typical workflow is unclear. In this work, we evaluate ML models for RCT classification (support vector machines, convolutional neural networks, and ensemble approaches). We trained and optimized support vector machine and convolutional neural network models on the titles and abstracts of the Cochrane Crowd RCT set. We evaluated the models on an external dataset (Clinical Hedges), allowing direct comparison with traditional database search filters. We estimated area under receiver operating characteristics (AUROC) using the Clinical Hedges dataset. We demonstrate that ML approaches better discriminate between RCTs and non-RCTs than widely used traditional database search filters at all sensitivity levels; our best-performing model also achieved the best results to date for ML in this task (AUROC 0.987, 95% CI, 0.984-0.989). We provide practical guidance on the role of ML in (1) systematic reviews (high-sensitivity strategies) and (2) rapid reviews and clinical question answering (high-precision strategies) together with recommended probability cutoffs for each use case. Finally, we provide open-source software to enable these approaches to be used in practice.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,210
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,559
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesMétarecherche
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,790
Score d'incertitude au seuil0,974

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,2100,559
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0040,004
Méta-épidémiologie (sens large)0,0070,006
Bibliométrie0,0170,012
Études des sciences et des technologies0,0010,003
Communication savante0,0060,006
Science ouverte0,0070,004
Intégrité de la recherche0,0070,012
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0190,012

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,426
Tête enseignante GPT0,623
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeSimulation ou modélisation
DomaineMéthodes
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations449
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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