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Enregistrement W2604801416 · doi:10.1158/1557-3125.dnarepair16-pr02

Abstract PR02: Small molecules that specifically inhibit the D-loop activity of RAD51

2017· article· en· W2604801416 sur OpenAlexaboutno aff
Brian Budke, Wei Lv, W. TUECKMANTEL, Alan P. Kozikowski, Philip P. Connell

Notice bibliographique

RevueMolecular Cancer Research · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA Repair Mechanisms
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRAD51Homologous recombinationDNADNA damageBiologyCancer cellChemistryCell biologyCancer researchMolecular biologyBiophysicsCancerBiochemistryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract RAD51 plays a central role in homologous recombination (HR), which maintains genome integrity. RAD51 is commonly overexpressed in cancer cells relative to normal tissue and is considered a therapeutic target in oncology. One potential challenge for targeting RAD51 pharmacologically is that it mediates functions in both double-strand DNA break (DSB) repair and stabilization of stalled replication forks. In order to distinguish compound-mediated effects on these RAD51 functions, we developed a novel class of RAD51 inhibitors. In contrast to many previously reported RAD51 inhibitors, we sought to develop compounds that do not inhibit RAD51's ability to bind single-stranded DNA (ssDNA). Instead, these compounds prevent RAD51-ssDNA nucleoprotein filaments from invading into homologous double-stranded DNA templates and forming D-loops. Our initial lead compound RI(dl)-1 (an abbreviation for RAD51 inhibitor of D-loop formation #1) is capable of blocking RAD51-mediated D-loop formation in biochemical assays, using concentrations that do not prevent RAD51 binding to ssDNA. An analog of this compound, termed RI(dl)-2, provides even better inhibition of RAD51's D-loop activity in biochemical systems (IC50 15.8 µM). RI(dl)-2 reduces HR activity in cells in dose ranges that do not stimulate single strand annealing (SSA) activity, which distinguishes it more generalized RAD51 inhibitors. RI(dl)-2 also sensitizes several cancer cell lines to radiation-induced death. We now present the results of more extensive structure activity relationship (SAR) optimizations aimed at further improving the potency and selectivity of this class of compounds. Several of these compounds are capable of delaying the timely resolution of radiation-induced RAD51 foci, even though initial RAD51 foci are apparently normal at earlier time points. Similar focus kinetics are observed for gamma-H2AX in identically treated cells, supporting the interpretation that these compounds permit RAD51 assembly at DSBs but prevent the completion of DSB repair. Unlike RI(dl)-2, some these newer compounds sensitize cancer cells to mitomycin C. These specialized RAD51 inhibitory compounds are attractive candidates for potential use as radiation or chemotherapy sensitizers, since they may exert fewer toxic risks compared to more generalized inhibitors of the HR repair machinery. They may also serve to help distinguish the functions of RAD51 DSB repair and replication stress tolerance, which may enable better understanding of RAD51's roles in maintaining genome stability. This abstract is also being presented as Poster A02. Citation Format: Brian Budke, Wei Lv, Werner Tueckmantel, Alan Kozikowski, Philip Connell. Small molecules that specifically inhibit the D-loop activity of RAD51 [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference on DNA Repair: Tumor Development and Therapeutic Response; 2016 Nov 2-5; Montreal, QC, Canada. Philadelphia (PA): AACR; Mol Cancer Res 2017;15(4_Suppl):Abstract nr PR02.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,718

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,095
Tête enseignante GPT0,371
Écart entre enseignants0,276 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
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