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Enregistrement W2604832180 · doi:10.1158/1557-3125.dnarepair16-pr21

Abstract PR21: DEK is critical for homologous recombination and its loss is synthetic lethal with DNA-PK inhibition

2017· article· en· W2604832180 sur OpenAlexaboutno aff
Eric A. Smith, Boris Gole, Nicholas A. Willis, Krumpelbeck F. Eric, Anil G. Jegga, Abdullah Mahmood Ali, Haihong Guo, Amom Ruhikanta Meetei, Paul R. Andreassen, Ferdinand Kappes, Ralph Scully, Lisa Wiesmüller, Wells I. Susanne

Notice bibliographique

RevueMolecular Cancer Research · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePARP inhibition in cancer therapy
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRAD51Homologous recombinationDNA repairGenome instabilitySynthetic lethalityDNADNA damageBiologyChromatinMolecular biologyCancer researchGeneticsCell biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract DEK is a highly conserved chromatin-bound protein whose upregulation across different cancer types directly correlates with genotoxic therapy resistance. While DEK loss induces genome instability and sensitizes cells to DNA double strand breaks (DSBs), suggesting defects in DNA repair, the role of DEK remains incompletely understood. To this end we previously determined that loss of DEK moderately attenuates non-homologous end-joining repair (NHEJ). However, the observed partial decrease in NHEJ activity is likely insufficient to fully explain the sensitivity of DEK-deficient cells to radiation and chemotherapy. Thus, we hypothesized that DEK has additional roles in DSB repair, particularly in homologous recombination (HR) DNA repair, a known contributor to chemotherapy resistance. We found that γH2AX activation and HR were strongly compromised in DEK-deficient cells, and that DEK physically interacted with and contributed to RAD51 recruitment. Thus, we hypothesized that DEK-deficient cells likely rely on residual NHEJ for repair of DSBs and survival. Correspondingly, NHEJ inhibition with DNA-PK inhibitors resulted in synthetic lethality in DEK-deficient cells. Together these findings define DEK as an important and multifunctional mediator of homologous recombination. This abstract is also being presented as Poster A09. Citation Format: Eric A. Smith, Boris Gole, Nicholas A. Willis, Krumpelbeck F. Eric, Anil G. Jegga, Abdullah M. Ali, Haihong Guo, Amom R. Meetei, Paul R. Andreassen, Ferdinand Kappes, Ralph Scully, Lisa Wiesmüller, Wells I. Susanne. DEK is critical for homologous recombination and its loss is synthetic lethal with DNA-PK inhibition [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference on DNA Repair: Tumor Development and Therapeutic Response; 2016 Nov 2-5; Montreal, QC, Canada. Philadelphia (PA): AACR; Mol Cancer Res 2017;15(4_Suppl):Abstract nr PR21.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,053
Score d'incertitude au seuil0,678

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,106
Tête enseignante GPT0,464
Écart entre enseignants0,357 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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