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Enregistrement W2605572910 · doi:10.23889/ijpds.v1i1.257

IMECCHI-DATANETWORK: empowering knowledge generation through international data network

2017· article· en· W2605572910 sur OpenAlexaffabout
Marie‐Annick Le Pogam, Amy Metcalf, Søren Paaske Johnsen, Phil Hider, Alka Patel, Hongsoo Kim, Emanuele Carlini, Raffaele Perego, Hude Quan, Rosa Gini

Notice bibliographique

RevueInternational Journal for Population Data Science · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBiomedical Text Mining and Ontologies
Établissements canadiensAlberta Health ServicesAlberta Children's HospitalUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRaw dataComputer scienceIdentifierData scienceTable (database)SoftwareData miningMatching (statistics)Protocol (science)Observational studyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT
 ObjectivesThe International Methodology Consortium for Coded Health Information (IMECCHI), an international collaboration of health services researchers, launched the IMECCHI-DATANETWORK initiative in October 2015. Its main objective is to enable replication of observational studies across countries through a distributed data infrastructure.
 ApproachIn a distributed data infrastructure, individual raw data are not shared. Instead, data are converted locally using a common data model (CDM) and loaded into a common software for data processing and analysis. Whenever a study protocol is agreed upon and ethically approved, an ad hoc procedure is programmed - using that software - including the data processing steps needed to create the analytical dataset from the CDM: record linkage, case selection, sampling, matching, etc. The procedure is then shared and locally run by each partner to generate an analytical dataset of integrated data. Analytical datasets may then be shared and pooled for statistical analyses.
 ResultsSix partners of the IMECCHI collaboration, located in countries across 4 continents (Canada, Denmark, Italy, New Zealand, South Korea, and Switzerland), currently participate in the initiative. They first conducted a survey to describe the origin, content, completeness and main attributes of each table in their original databases. Based on the results of the survey, a CDM was created, encompassing 4 tables of coded or structured data to be linked at the individual level using a common personal identifier: (1) characteristics of the subjects with dates of birth and death; (2) hospital discharge summaries with diagnosis and procedure codes, and admission, discharge and procedure dates; (3) drug dispensing information with date of dispensing, drug name, duration of the amount of active principle according to the Defined Daily Dose of the World Health Organization; (4) causes of death. In each table, additional attributes describe the coding systems in which the other attributes are coded. Using such specific attributes facilitates interoperability across multiple coding systems. The open source Java-based software, TheMatrix, which operates on flat csv files using a domain-specific programming language, was chosen to embed the ad hoc procedure.
 ConclusionWithin the IMECCHI-DATANETWORK initiative, databases from various countries will be locally converted in a CDM which will facilitate study replication in a distributed fashion while granting interoperability across coding systems. Through such international data networks, data are empowered for creating results which are generalizable to multiple countries. Cross-border data sharing and international comparisons are also facilitated.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesScience ouverte
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,754
Score d'incertitude au seuil0,998

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0080,003
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,207
Tête enseignante GPT0,484
Écart entre enseignants0,277 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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