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Enregistrement W2606974296

Characterization of an Equine Rhinitis A Virus (ERAV/ON/05) and Development of an Experimental Infection Model in Horses

2012· dissertation· en· W2606974296 sur OpenAlexaboutno aff
Andrés Diaz-Méndez

Notice bibliographique

RevueThe Atrium (University of Guelph) · 2012
Typedissertation
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueViral gastroenteritis research and epidemiology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésVirologyCharacterization (materials science)VirusMedicineBiologyImmunologyNanotechnologyMaterials science
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In 2005 an equine rhinitis A virus (ERAV) isolate was recovered from a\nfebrile horse during a respiratory outbreak in Ontario. This isolate (ERAV/ON/05)\nwas propagated in cell culture and used to study its genomic characteristics and\nto investigate the clinical features in experimentally infected ponies. The fulllength\ngenome of this isolate was sequenced and compared with other ERAV\navailable in GenBank. The isolate genome is 7839 nucleotides (nts) in length\nwith a variable 5’UTR and a more conserved 3’UTR. When the isolate was\ncompared to other reported ERAV, an insertion of 13 nts in the 5’UTR was\nidentified. Phylogenetic analysis demonstrated that ERAV/ON/05 was closely\nrelated to the ERAV/PERV isolate, which was recovered in 1962 in the United\nKingdom. An experimental model was developed to study the clinical infection in\nnaïve healthy ponies (ERAV/ON/05 n=4 and placebo n=4). ERAV/ON/05\ninduced clinical respiratory disease compared to placebo. The clinical signs\nconsisted of pyrexia, nasal discharge, increased and abnormal lung sounds,\nincreased size of submandibular lymph nodes and persistent mucopus in the\ntrachea (up to 21 days post-infection). The virus was isolated from the lower and\nupper airways up to day 7 post-infection, corresponding with the detection of\nneutralizing ERAV antibodies. Assessment of the cytokine profile from\nbronchoalveolar lavage (BAL) cells demonstrated that this infection induced\ndown-regulation of the mRNA expression of IL-4. One year later, four previously\ninfected ponies with neutralizing antibodies to ERAV were assigned to a reinfection\ntrial. None of the re-infected ponies developed clinical disease, and only\none animal had a four-fold increase in antibody titres to ERAV. Attempts to\nrecover the virus from the re-infected ponies using cell culture were negative;\nhowever, a down-regulation of the mRNA expression of IL-4 and IFN-β was\nidentified in BAL cells. In conclusion, this study shows that the genome of ERAV has not\nsignificantly changed in the last 50 years and more importantly the virus induces\nclinical respiratory disease similar to other common equine respiratory viruses.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,302
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission1
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