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Enregistrement W2607494908 · doi:10.4172/2157-7013.1000217

TSGA10 is a Centrosomal Protein, Interacts with ODF2 and Localizes to Basal Body

2015· article· en· W2607494908 sur OpenAlexfundno aff
Babak Behnam Mahsa Mobahat

Notice bibliographique

RevueJournal of Cell Science & Therapy · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicrotubule and mitosis dynamics
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversity of Calgary
Mots-clésBasal bodyCell biologyBasal (medicine)Process (computing)BiologyComputer scienceFlagellumGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

TSGA10 is overexpressed in some cancers, during neural development, in embryogenesis, and in several tissues with actively dividing cells. TSGA10 protein localization to the sperm tail has been previously described. The protein is cleaved into two parts, which appear to play different functions in the sperm tail: the 27-KDa N-terminal is localized to the fibrous sheath in the principal piece, whereas its 55-KDa C-terminal of the TSGA10 forms filaments, decreases transcriptional activity of hypoxia-inducible factor (HIF)-1-alpha and accumulates in the midpiece of mature spermatozoa. Using colocalization, and coimmunoprecipitation assays, we show that TSGA10 interacts with ‘Outer Dense Fiber 2’ (ODF2), a centrosome scaffold component associated with mother centrioles. Also, our yeast two-hybrid assay shows that the full-length TSGA10 protein and its 55-KDa C-terminus portion predominantly interact with ODF2. However, the truncated N-terminus 27-KDa fibrous sheath component of TSGA10 fails to bind ODF2. Our experiments examining the localization of TSGA10, demonstrated that the full length TSGA10 protein localizes to perinuclear structures, colocalizes with γ-tubulin, and associates with the centrosome and basal body. The TSGA10 55-KDa C-terminus, but not its 27-KDa N-terminus also localizes to the centrosome and basal body. Our Real-time PCR data indicated that the levels of TSGA10 and ODF2 genes expressions correlate, in mice testes. Finally, we propose that TSGA10 is a ciliary-centrosomal protein and therefore is a good candidate for further investigation in ciliopathies, as well as, cancer biology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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