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Enregistrement W2607785336 · doi:10.1001/jamaoncol.2017.0502

Association Between <i>SLC16A5</i> Genetic Variation and Cisplatin-Induced Ototoxic Effects in Adult Patients With Testicular Cancer

2017· article· en· W2607785336 sur OpenAlex
Britt I. Drögemöller, Jose Gerard Monzon, Amit P. Bhavsar, Adrienne E. Borrie, Beth Brooks, Galen E.B. Wright, Geoffrey Liu, Daniel J. Renouf, Christian Kollmannsberger, Philippe L. Bédard, Folefac Aminkeng, Ursula Amstutz, Claudette Hildebrand, Erandika P. Gunaretnam, Carol Critchley, Zhuo Chen, Liam R. Brunham, Michael R. Hayden, Colin J.D. Ross, Karen A. Gelmon, Bruce Carleton

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.

Notice bibliographique

RevueJAMA Oncology · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueHearing, Cochlea, Tinnitus, Genetics
Établissements canadiensVancouver General HospitalBC Cancer AgencyPrincess Margaret Cancer CentreUniversity of TorontoBC Children's HospitalUniversity Health NetworkUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineTesticular cancerInterquartile rangeCisplatinPharmacogenomicsInternal medicineOncologyOdds ratioOtotoxicityChemotherapyCancerPharmacogeneticsBioinformaticsGenotypePharmacologyGeneticsBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

IMPORTANCE: Cisplatin-induced ototoxic effects are an important complication that affects testicular cancer survivors as a consequence of treatment. The identification of genetic variants associated with this adverse drug reaction will further our mechanistic understanding of its development and potentially lead to strategies to prevent ototoxic effects. OBJECTIVE: To identify the genetic variants associated with cisplatin-induced ototoxic effects in adult testicular cancer patients. DESIGN, SETTING, AND PARTICIPANTS: This retrospective study was performed by the Canadian Pharmacogenomics Network for Drug Safety using patients recruited from 5 adult oncology treatment centers across Canada. Male patients who were 17 years or older, diagnosed with germ cell testicular cancer, and previously treated with cisplatin-based chemotherapy were recruited from July 2009 to April 2013 using active surveillance methodology. Cisplatin-induced ototoxic effects were independently diagnosed by 2 audiologists. Patients were genotyped for 7907 variants using a custom pharmacogenomic array. Logistic regression was used to identify genetic variants that were significantly associated with ototoxic effects. The validity of these findings was confirmed through independent replication and cell-based functional assays. EXPOSURES: Cisplatin-based chemotherapy. MAIN OUTCOMES AND MEASURES: Cisplatin-induced ototoxic effects. RESULTS: After exclusions, 188 patients (median [interquartile range] age, 31 [24-39] years) were enrolled in this study to form the discovery and replication cohorts. Association and fine-mapping analyses identified a protein-coding variant, rs4788863 in SLC16A5, that was associated with protection against cisplatin-induced ototoxic effects in 2 independent cohorts (combined cohort: odds ratio, 0.06; 95% CI, 0.02-0.22; P = 2.17 × 10-7). Functional validation of this transporter gene revealed that in vitro SLC16A5-silencing altered cellular responses to cisplatin treatment, supporting a role for SLC16A5 in the development of cisplatin-induced ototoxic effects. These results were further supported by the literature, which provided confirmatory evidence for the role that SLC16A5 plays in hearing. CONCLUSIONS AND RELEVANCE: This study has identified a novel association between protein-coding variation in SLC16A5 and cisplatin-induced ototoxic effects. These findings have provided insight into the molecular mechanisms of this adverse drug reaction in adult patients with germ cell testicular cancer. Given that previous studies have shown that cimetidine, an SLC16A5-inhibitor, prevents murine cisplatin-induced ototoxic effects, the findings from this study have important implications for otoprotectant strategies in humans.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,043
Score d'incertitude au seuil0,762

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,292
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle