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Enregistrement W2609563619 · doi:10.24870/cjb.2017-000104

Plasmids containing the same origin of replication are useful tools to perform biotechnological studies in Pseudomonas putida U and in E. coli DH10B

2017· article· en· W2609563619 sur OpenAlexvenueno aff
Manuel de la Torre, Madalena Humanes, Elı́as R. Olivera, José M. Luengo

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Biotechnology · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial Genetics and Biotechnology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesJunta de Castilla y LeónMinisterio de Economía y CompetitividadCentro para el Desarrollo Tecnológico Industrial
Mots-clésPseudomonas putidaPlasmidReplication (statistics)PseudomonasBiologyMicrobiologyBacteriaGeneticsVirologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Plasmids containing the same origin of replication (pBBR1MCS-2 Km R and pBBR1MCS-3 Tc R ) have been used to express simultaneous and independently different proteins in P. putida U and in E. coli.Thus, when P. putida was transformed with different genetic constructions made in the same plasmid (pBBR1MCS-3 Tc R ), or with plasmids containing the same replication origin but with different antibiotic resistant genes (Km R and Tc R ), they co-existed inside the same microbe.Furthermore, when E. coli DH10B was transformed with the plasmids recovered from the recombinant P. putida U, we noticed that all the bacteria isolated from single colonies are resistant to Km and Tc, suggesting that these plasmids were also present in E. coli.This observation facilitates the genetic manipulation of these strains (i.e.avoiding the use of different plasmids in double or multiple complementation experiments), and could be an interesting tool to approach many metabolic and biotechnological studies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,059
Tête enseignante GPT0,303
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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