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Enregistrement W2610780597 · doi:10.13140/rg.2.1.3987.3520

"Civelle, dis-nous où tu migres et nous te dirons à l'écotype auquel tu appartiens"

2015· article· fr· W2610780597 sur OpenAlexaffabout
Mélanie Gaillard, Louis Bernatchez, Céline Audet

Notice bibliographique

RevueHAL (Le Centre pour la Communication Scientifique Directe) · 2015
Typearticle
Languefr
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and phenotypic traits in livestock
Établissements canadiensUniversité du Québec à Rimouski
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEcotypeForestryMolecular biologyBiologyHumanitiesGeographyPhilosophyBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Chez les anguilles d’Amerique, deux phenotypes ont ete differencies genetiquement : ecotype d’eau douce dans l’estuaire et le fleuve St Laurent, ecotype d’eau salee-saumâtre en Atlantique. Dans le but de clarifier les bases genetiques sous-jacentes de ces ecotypes, l’expression de divers genes a ete caracterisee chez des civelles (le stade qui suit la metamorphose), des leur arrivee en region estuarienne. Leur preference de salinite individuelle a ete consideree. Les civelles ont ete capturees a deux reprises (intervalle d’une quinzaine de jours), dans l’estuaire de trois rivieres graduellement eloignees de la zone de reproduction : riviere Mersey (cote Atlantique), riviere Gaspe (Golfe du St-Laurent), Grande-Riviere-Blanche (estuaire du St-Laurent). La preference de salinite individuelle (eau douce, eau saumâtre ou eau salee) a ete mesuree juste apres la capture. Des analyses d’expression de genes ont ete effectuees par PCR en temps reel avec des sondes Taqman pour trois genes de reference et quatorze genes candidats impliques dans le metabolisme des lipides, du glycogene, la metamorphose, les processus d’osmoregulation et de la croissance. Les resultats ont ete analyses en deux temps selon deux hypotheses nulles: le metabolisme des lipides et du glycogene ne varient ni en fonction de l’origine, ni de la date de capture. Les traits relies a la regulation de l’osmoregulation, de la croissance et de la metamorphose ne varient ni selon l’origine, ni selon la preference de salinite individuelle. Des variations genetiques pour differents traits fonctionnels s’observent selon l’origine de capture. Les civelles capturees dans l’estuaire du Saint-Laurent sont caracterisees par de grande taille et montrent les plus hauts niveaux d’expression des lipases et du recepteur IGF-1. Les civelles capturees dans la region de Gaspe sont non pigmentees et de grande taille et montrent les niveaux d’expression les plus eleves pour les genes representatifs de l’axe thyroidien. Enfin, les civelles capturees en Atlantique sont de petite taille et montrent les plus faibles niveaux d’expression de l’axe somatotrope et de l’enzyme deiodinase. Ces traits ne variaient ni en fonction de la preference de salinite individuelle, ni de la date d’arrivee. Ces resultats montrent que des differences d’expression pouvant avoir des consequences physiologiques importantes selon la riviere d’origine et qui pourraient resulter d’interactions genes × environnent. Une meilleure comprehension de ces caracteristiques biologiques pourrait orienter les futures tentatives de rehabilitation du stock de civelles au Canada en apportant des informations utiles pour la gestion des pecheries.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,024
Score d'incertitude au seuil0,047

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,232
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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