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Record W2610780597 · doi:10.13140/rg.2.1.3987.3520

"Civelle, dis-nous où tu migres et nous te dirons à l'écotype auquel tu appartiens"

2015· article· fr· W2610780597 on OpenAlexaffabout
Mélanie Gaillard, Louis Bernatchez, Céline Audet

Bibliographic record

VenueHAL (Le Centre pour la Communication Scientifique Directe) · 2015
Typearticle
Languagefr
FieldBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
TopicGenetic and phenotypic traits in livestock
Canadian institutionsUniversité du Québec à Rimouski
Fundersnot available
KeywordsEcotypeForestryMolecular biologyBiologyHumanitiesGeographyPhilosophyBotany

Abstract

fetched live from OpenAlex

Chez les anguilles d’Amerique, deux phenotypes ont ete differencies genetiquement : ecotype d’eau douce dans l’estuaire et le fleuve St Laurent, ecotype d’eau salee-saumâtre en Atlantique. Dans le but de clarifier les bases genetiques sous-jacentes de ces ecotypes, l’expression de divers genes a ete caracterisee chez des civelles (le stade qui suit la metamorphose), des leur arrivee en region estuarienne. Leur preference de salinite individuelle a ete consideree. Les civelles ont ete capturees a deux reprises (intervalle d’une quinzaine de jours), dans l’estuaire de trois rivieres graduellement eloignees de la zone de reproduction : riviere Mersey (cote Atlantique), riviere Gaspe (Golfe du St-Laurent), Grande-Riviere-Blanche (estuaire du St-Laurent). La preference de salinite individuelle (eau douce, eau saumâtre ou eau salee) a ete mesuree juste apres la capture. Des analyses d’expression de genes ont ete effectuees par PCR en temps reel avec des sondes Taqman pour trois genes de reference et quatorze genes candidats impliques dans le metabolisme des lipides, du glycogene, la metamorphose, les processus d’osmoregulation et de la croissance. Les resultats ont ete analyses en deux temps selon deux hypotheses nulles: le metabolisme des lipides et du glycogene ne varient ni en fonction de l’origine, ni de la date de capture. Les traits relies a la regulation de l’osmoregulation, de la croissance et de la metamorphose ne varient ni selon l’origine, ni selon la preference de salinite individuelle. Des variations genetiques pour differents traits fonctionnels s’observent selon l’origine de capture. Les civelles capturees dans l’estuaire du Saint-Laurent sont caracterisees par de grande taille et montrent les plus hauts niveaux d’expression des lipases et du recepteur IGF-1. Les civelles capturees dans la region de Gaspe sont non pigmentees et de grande taille et montrent les niveaux d’expression les plus eleves pour les genes representatifs de l’axe thyroidien. Enfin, les civelles capturees en Atlantique sont de petite taille et montrent les plus faibles niveaux d’expression de l’axe somatotrope et de l’enzyme deiodinase. Ces traits ne variaient ni en fonction de la preference de salinite individuelle, ni de la date d’arrivee. Ces resultats montrent que des differences d’expression pouvant avoir des consequences physiologiques importantes selon la riviere d’origine et qui pourraient resulter d’interactions genes × environnent. Une meilleure comprehension de ces caracteristiques biologiques pourrait orienter les futures tentatives de rehabilitation du stock de civelles au Canada en apportant des informations utiles pour la gestion des pecheries.

Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.

How this classification was reachedexpand

Full frame machine prediction

Teacher imitation

Not calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.

metaresearch head score (Codex)0.000
metaresearch head score (Gemma)0.001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cValidation status: machine_predicted_unvalidated
Candidate categoriesnone
Consensus categoriesnone
DomainCandidate signal: none · Consensus signal: none
Study designCandidate signal: Observational · Consensus signal: none
GenreCandidate signal: Empirical · Consensus signal: Empirical
Teacher disagreement score0.024
Threshold uncertainty score0.047

Distilled classifier scores by category (both heads)

CategoryCodexGemma
Metaresearch0.0000.001
Meta-epidemiology (narrow)0.0000.000
Meta-epidemiology (broad)0.0000.000
Bibliometrics0.0000.000
Science and technology studies0.0010.001
Scholarly communication0.0010.000
Open science0.0000.001
Research integrity0.0000.001
Insufficient payload (model declined to judge)0.0060.001

Machine scores (provisional)

The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.

Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.

Opus teacher head0.015
GPT teacher head0.232
Teacher spread0.217 · how far apart the two teachers sit on this one work
Validation statusscore_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from it

Classification

machine, unvalidated

Machine predicted; a candidate call from one source (direct Gemma or distilled Codex), not a consensus.

The models applied no category: nothing in the taxonomy fit this work.
Study designObservational
Domainnot available
GenreEmpirical

How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".

Quick stats

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Published2015
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