Updated molecular analyses of exons 19 and 21 of the epidermal growth factor receptor (<i>EGFR</i>) gene and codons 12 and 13 of the <i>KRAS</i> gene in non-small cell lung cancer (NSCLC) patients treated with erlotinib in National Cancer Institute of Cancer
Notice bibliographique
Résumé
7571 Background: BR.21 demonstrated significant survival benefit from erlotinib for NSCLC patients (Shepherd, NEJM 2005). EGFR gene point mutations in exon 21 and deletions in exon 19 predict response to EGFR TKIs, but the predictive value of EGFR mutations (Mut) or high copy number (Amp) on survival remains unclear. Methods: The sensitivity of PCR-sequencing to detect EGFR mutations may be suboptimal. Thus, we re-analyzed all BR.21 samples with available material using a fluourescent-based PCR technique (Pan, JMD 2005;7:396) and ScorpionIM kits (DxS, Manchester, UK) as they may detect mutations in samples with only 5–10% tumor DNA. 204 samples were analyzed successfully for EGFR Mut, 206 for KRAS Mut and 159 by FISH for EGFR Amp. Results: Exon 19 deletion and/or exon 21 L858R Mut were identified in 34 patients (overall Mut rate 17%). EGFR high polysomy or true amplification was present in 61 patients (38%), and 30 patients (15%) had KRAS Mut. Overall response rates were EGFR wildtype (WT)/Mut: 7%/27%, p=0.03; KRAS WT/Mut: 10%/5%, p=0.69; No Amp/Amp: 5%/21%, p=0.02. Hazard ratios for survival benefit were EGFR WT: 0.74 (0.52–1.05, p=0.09), Mut: 0.55 (0.25–1.19, p=0.12); KRAS WT: 0.69 (0.9–0.97, p=0.03), Mut: 1.67 (0.62–4.50, p=0.31); no Amp: 0.80 (0.49–1.29, p=0.35), Amp: 0.43 0.23–0.78, p=0.004). The test for interaction was borderline for KRAS Mut (0.09) but was not significant for EGFR Mut (p=0.47) or EGFR Amp (0.12). It was significant only for non-smokers with EGFR Amp (p=0.04). In the multiple Cox regression model, including all markers, EGFR Amp was both prognostic for poorer survival (p=0.005) and predictive of a differential survival benefit from erlotinib (p=0.009). EGFR and KRAS Mut were not significant prognostic or predictive markers. Conclusion: EGFR genotype and copy number are predictive of objective response to erlotinib. In BR.21, EGFR gene copy number is the strongest molecular prognostic marker and the only significant molecular predictor of a differential survival benefit from treatment. [Table: see text]
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».