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Enregistrement W2611361256 · doi:10.25011/cim.v31i4.4788

THE TRANSCRIPTION FACTOR Y-BOX BINDING PROTEIN-1 (YB-1) INDUCES EXPRESSION OF THE PIK3CA ONCOGENE LEADING TO INCREASED INVASION OFBASAL-LIKE BREAST CARCINOMA CELLS

2008· article· en· W2611361256 sur OpenAlexvenueno aff
Arezoo Astanehe, Melanie Finkbeiner, Karen To, Sandra E. Dunn

Notice bibliographique

RevueClinical and investigative medicine · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBRCA gene mutations in cancer
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChromatin immunoprecipitationCancer researchTranscription factorPromoterBiologyOncogenePI3K/AKT/mTOR pathwayMolecular biologyCancerGene expressionCell cycleGeneticsGeneApoptosis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Basal-like breast carcinoma (BLBC) is the mostaggressive subtype of breast cancer. 73% of BLBC over-express YB-1, anoncogenic transcription/translation factor. PIK3CA, which codes for the p110? catalytic subunit ofphosphatidylinositol-3-kinase (PI3K), is another oncogene. The PI3K signalling pathway is fundamental in the regulation of many cellular functions and isoften deregulated in cancer. Despite its importance, the knowledge on the transcriptional regulation of PIK3CA is limited. Indeed, we have recently published the first report on the PIK3CA promoter. Methods and Results: A genome-wide chromatin immunoprecipitation on chip (ChIP-on-chip) analysis of a BLBC cell-line(SUM149) suggested binding of YB-1 to the PIK3CA promoter. This binding was verified using traditional chromatin immunoprecipitation (ChIP). Furthermore, electrophoretic mobility shift assay (EMSA) using oligonucleotides with eitherwild-type or mutated YB-1 responsive elements mapped YB-1 binding to three sites on the PIK3CA promoter. Silencing YB-1 in BLBC cell-lines (SUM149, HCC1937, andMDA-MB-231) decreased, while over-expression of YB-1 increased the PIK3CA promoter activity, transcript, and protein levels. Interestingly, array comparative genomic hybridization(aCGH) and quantitative PCR demonstrated PIK3CA copy number gains in HCC1937 andMDA-MB-231 cells. Although PIK3CA amplifications are overall uncommon (9%) in breast cancer, we demonstrated here that low level gains in PIK3CA copy number are present in 30%of primary BLBC cases. Furthermore, it has previously been demonstrated that mutations of PIK3CA are the most common genetic aberration (27%) found in breast cancer. These mutations lead to constitutive activation of p110? and are highly oncogenic. Over-expression of YB-1in MCF-7 cells, which harbour an activating PIK3CA mutation, increased PIK3CA transcript and protein levels. Furthermore, induction of PIK3CA by YB-1 leads to increased levels of urokinase plasminogenactivator (uPA) and invasion. Conclusions: Our data demonstrates that YB-1 binds to the PIK3CA promoter and induces itsexpression whether the gene is wild-type or amplified. Moreover, since YB-1induces expression of the active mutant p110?, then therapeutic inhibition of YB-1 may lead to decreased p110? and interference with the constitutively activated PI3K pathway in cancers. In addition, the YB-1/PIK3CA/uPA network provides information regarding the possible therapeutic targets for prevention of breast cancer invasion and metastasis. A.A. is supported by a Child and Family–CIHR–UBC MD/PhD Studentship Award.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,106
Tête enseignante GPT0,316
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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