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Enregistrement W2611753880 · doi:10.1093/botlinnean/box009

Phylogenetic and biogeographical history of the Afro-Madagascan genera Delonix, Colvillea and Lemuropisum (Fabaceae: Caesalpinioideae)

2017· article· en· W2611753880 sur OpenAlexafffund
Marielle Babineau, Anne Bruneau

Notice bibliographique

RevueBotanical Journal of the Linnean Society · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Diversity and Evolution
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesFonds de recherche du Québec – Nature et technologiesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversität Zürich
Mots-clésBiologyMonophylyCaesalpinioideaePhylogenetic treeBotanyGenusCladeFabaceaeZoology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Our understanding of the taxonomic limits and biogeographical evolution of the Afro-Madagascan genus Delonix and the closely related monospecific Madagascan endemic genera Colvillea and Lemuropisum have been hampered by unresolved intergeneric and interspecific relationships. Here we study the phylogenetics of the group using nucleotide sequences from ribosomal ITS, four low-copy nuclear genes and four plastid regions. We find poorly resolved gene trees typical of closely related species, but most species are resolved as monophyletic, and we report conflicting phylogenetic placements only for D. brachycarpa and C. racemosa. A time-calibrated biogeographical analysis of the concatenated matrix of all nine loci suggests that the ancestral area of the Delonix, Lemuropisum and Colvillea clade was in south-western Madagascar c. 24–18 Ma. An out-of-Madagascar dispersal to Africa took place during the Miocene, most likely by vegetative rafting. Delonix is not monophyletic due to the robustly supported placement of L. edule in Delonix, warranting treatment of Lemuropisum as congeneric with Delonix and establishment of the new name combination Delonix edule, in line with the close morphological similarities between these two genera. In contrast, the phylogenetic position of C. racemosa is unstable occurring in the Delonix–Lemuropisum clade in the nuclear gene trees, but sister to this clade in the plastid gene tree. The status of Colvillea as a distinct genus, therefore, remains questionable, but it is here maintained based on a suite of morphological distinctions, pending further insights into the relationships of this elusive genus.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,398
Score d'incertitude au seuil0,414

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,178
Écart entre enseignants0,160 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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