QUANTIFICATION PAR PCR QUANTITATIF COMPÉTITIF ETDÉTECTION PAR HYBRIDATION IN SITU DU ChfuGV CHEZ LESLARVES DE CHORISTONEURA FUMIFERANA(LEPIDOPTERA:TORTRICIDAE)
Notice bibliographique
Résumé
La tordeuse des bourgeons de l'épinette (Choristoneura fumiferana) est le plus \ngrand défoliateur des forêts boréales du Québec. Cet insecte, qui est caractérisé par des \ninvasions importantes des populations, engendre des pertes économiques considérables \ndans le domaine de la foresterie. Le granulovirus retrouvé chez la tordeuse (ChfuGV) \nsemble être un agent de lutte biologique intéressant puisqu'il provoque, au laboratoire, la \nmort de l'insecte sur une période d'environ dix jours. Afin de définir les caractéristiques \ncontribuant à l'efficacité du granulovirus comme agent de lutte biologique, la \ndétermination de la charge virale chez les insectes infectés et l'identification des tissus \ncibles pour la réplication du ChfuGV ont fait l'objet de cette étude. Par l'entremise de \nPCR quantitatif compétitif et de gels de polyacrylamide, la quantité de copies du génome \ndu ChfuGV et la quantité de granuline ont pu respectivement être déterminés chez les \nlarves infectées par le virus. Des hybridations moléculaires effectuées sur des coupes \nminces d'insectes infectés ont permis d'identifier les tissus ciblés par le ChfuGV lors de \nsa réplication. Les analyses quantitatives par PCR compétitif ont permis de mettre en \névidence une augmentation constante du ChfuGV jusqu'au septième jour suivant \nl'infection. Par la suite, la quantité de copies du génome viral semble diminuer. D'autre \npart, une augmentation constante de la granuline, protéine majeure du virus, a été \nobservée suite à l'analyse par gel de polyacrylamide. Les hybridations ont démontré la \nprésence du génome viral dans les cellules intestinales, adipeuses et hypodermales des \ninsectes infectés par le virus. La méthode d'hybridation in situ a permis de caractériser le \nChfuGV comme étant un granulovirus provoquant un syndrome de type II chez son hôte. \nCe syndrome se caractérise par la réplication du ChfuGV dans le noyau des cellules \nintestinales, des cellules adipeuses et des cellules hypodermiques chez C. fumiferana. La \nmise au point d'une méthode de quantification virale par PCR est un outil intéressant qui \npourra éventuellement être utilisé lors de la production du ChfuGV à grande échelle. Elle \npermet de déterminer la durée d'incubation des insectes infectés avant de récolter le virus.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».