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Enregistrement W2613292714 · doi:10.1038/ncomms15244

HLA-DP84Gly constitutively presents endogenous peptides generated by the class I antigen processing pathway

2017· article· en· W2613292714 sur OpenAlexaff
Yūki Yamashita, Mark Anczurowski, Munehide Nakatsugawa, Makito Tanaka, Yuki Kagoya, Ankit Sinha, Kenji Chamoto, Toshiki Ochi, Tingxi Guo, Kayoko Saso, Marcus O. Butler, Mark D. Minden, Thomas Kislinger, Naoto Hirano

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmunotherapy and Immune Responses
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreUniversity Health NetworkUniversity of TorontoOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteNational Institutes of Health
Mots-clésTransporter associated with antigen processingAntigen processingCD74Antigen presentationMHC class IEndoplasmic reticulumCell biologyEndogenyAntigenBiologyMHC class IIEndosomePeptideHuman leukocyte antigenIntracellularMajor histocompatibility complexChemistryBiochemistryGeneticsCytotoxic T cell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Classical antigen processing leads to the presentation of antigenic peptides derived from endogenous and exogenous sources for MHC class I and class II molecules, respectively. Here we show that, unlike other class II molecules, prevalent HLA-DP molecules with β-chains encoding Gly84 (DP 84Gly ) constitutively present endogenous peptides. DP 84Gly does not bind invariant chain (Ii) via the class II-associated invariant chain peptide (CLIP) region, nor does it present CLIP. However, Ii does facilitate the transport of DP 84Gly from the endoplasmic reticulum (ER) to the endosomal/lysosomal pathway by transiently binding DP 84Gly via a non-CLIP region(s) in a pH-sensitive manner. Accordingly, like class I, DP 84Gly constitutively presents endogenous peptides processed by the proteasome and transported to the ER by the transporter associated with antigen processing (TAP). Therefore, DP 84Gly , found only in common chimpanzees and humans, uniquely uses both class I and II antigen-processing pathways to present peptides derived from intracellular and extracellular sources.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesÉtudes des sciences et des technologies
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,733
Score d'incertitude au seuil0,995

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0060,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0030,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,044
Tête enseignante GPT0,302
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations40
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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