MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2613321519 · doi:10.1002/path.4915

Frequent <i><scp>IDH2</scp></i><scp>R172</scp> mutations in undifferentiated and poorly‐differentiated sinonasal carcinomas

2017· article· en· W2613321519 sur OpenAlexaff
Snjezana Doğan, Deborah J. Chute, Bin Xu, Ryan Ptashkin, Raghu Chandramohan, Jacklyn Casanova, Khédoudja Nafa, Justin A. Bishop, Simion I. Chiosea, Edward B. Stelow, Ian Ganly, David G. Pfister, Nora Katabi, Ronald Ghossein, Michael F. Berger

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Pathology · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHead and Neck Surgical Oncology
Établissements canadiensHealth Sciences CentreSunnybrook Health Science Centre
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthCleveland Clinic
Mots-clésSanger sequencingCDKN2ABiologyIDH2KRASIDH1Cancer researchHRASMalignancyExonPathologyCancerMutationGeneticsMedicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Sinonasal undifferentiated carcinoma ( SNUC ) is a high‐grade malignancy with limited treatment options and poor outcome. A morphological spectrum of 47 sinonasal tumours including 17 (36.2%) SNUCs was analysed at genomic level. Thirty carcinomas (cohort 1) were subjected to a hybridization exon‐capture next‐generation sequencing assay ( MSK‐IMPACT TM ) to interrogate somatic variants in 279 or 410 cancer‐related genes. Seventeen sinonasal tumours (cohort 2) were examined only for the presence of IDH1 /2 exon 4 mutations by Sanger sequencing. IDH2 R172 single nucleotide variants were overall detected in 14 (82.4%) SNUCs , in two (20%) poorly‐differentiated carcinomas with glandular/acinar differentiation, and in one of two high‐grade neuroendocrine carcinomas, large cell type ( HGNECs ). No IDH2 mutation was detected in any of five olfactory neuroblastomas or in any of five SMARCB1 ‐deficient carcinomas. Among 12 IDH2 ‐mutated cases in cohort 1, five (41.7%) harboured co‐existing TP53 mutations, four (33.3%) CDKN2A / 2B loss‐of‐function alterations, four (33.3%) MYC amplification, and three (25%) had concurrent SETD2 mutations. AKT1 E17K and KIT D816V hotspot variants were each detected in one IDH2 ‐mutated SNUC . The vast majority of SNUCs and variable proportions of other poorly‐differentiated sinonasal carcinomas may be amenable to IDH2 ‐targeted therapy. Copyright © 2017 Pathological Society of Great Britain and Ireland. Published by John Wiley &amp; Sons, Ltd.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,300
Score d'incertitude au seuil0,738

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,305
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations112
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe Journal of PathologyMême sujetHead and Neck Surgical OncologyTravaux en français237 207