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Enregistrement W2614432952 · doi:10.1097/01.anes.0000530185.78660.da

CASQ1 Gene Is an Unlikely Candidate for Malignant Hyperthermia Susceptibility in the North American Population

2013· article· en· W2614432952 sur OpenAlexafffund
Natalia Kraeva, Elena Zvaritch, Wanda Frodis, Olga Sizova, Alexander Kraev, David H. MacLennan, Sheila Riazi

Notice bibliographique

RevueAnesthesiology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensToronto General HospitalToronto Public HealthHome and Community Care Support ServicesUniversity Health Network
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésCalsequestrinMalignant hyperthermiaPopulationGeneticsLocus (genetics)Candidate geneCoding regionMedicineAlleleGeneBiologyAnesthesiaReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Malignant hyperthermia (MH, MIM# 145600) is a complex pharmacogenetic disorder that is manifested in predisposed individuals as a potentially lethal reaction to volatile anesthetics and depolarizing muscle relaxants. Studies of CASQ1-null mice have shown that CASQ1, encoding calsequestrin 1, the major Ca2+ binding protein in the lumen of the sarcoplasmic reticulum, is a candidate gene for MH in mice. The aim of this study was to establish whether the CASQ1 gene is associated with MH in the North American population. METHODS: The entire coding region of CASQ1 in 75 unrelated patients diagnosed by caffeine-halothane contracture test as MH susceptible (MHS) was analyzed by DNA sequencing. Subsequently, three groups of unrelated individuals (130 MHS, 100 MH negative, and 192 normal controls) were genotyped for a variant that was identified by sequencing. Levels of CASQ1 expression in the muscle from unrelated MHS and MH negative individuals were estimated by Western blotting. RESULTS: Screening of the entire coding sequence of the CASQ1 gene in 75 MHS patients revealed a single variant c.260T > C (p.Met87Thr) in exon 1. This variant is unlikely to be pathogenic, because its allele frequency in the MHS group was not significantly different from that of controls. There was also no difference in calsequestrin 1 protein levels between muscle samples from MHS and controls, including those carrying the p.Met87Thr variant. CONCLUSIONS: This study revealed a low level of protein coding sequence variability within the human CASQ1 gene, indicating that CASQ1 is not a major MHS locus in the North American population.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,053
Score d'incertitude au seuil0,361

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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