MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2616817562 · doi:10.1038/ncomms15451

Whole genome analysis of a schistosomiasis-transmitting freshwater snail

2017· article· en· W2616817562 sur OpenAlexafffund
Coen M. Adema, LaDeana W. Hillier, Catherine S. Jones, Eric S. Loker, Matty Knight, Patrick Minx, Guilherme Oliveira, Nithya Raghavan, Andrew M. Shedlock, Laurence Rodrigues do Amaral, Halime D. Arican-Goktas, Juliana Assis Geraldo, Elio H. Baba, Olga Lucia Baron, Christopher J. Bayne, Utibe Bickham-Wright, Kyle K. Biggar, Michael S. Blouin, Bryony C. Bonning, Chris Botka, Joanna M. Bridger, Katherine M. Buckley, Sarah K. Buddenborg, Roberta Lima Caldeira, Julia B. Carleton, Omar S Carvalho, Maria G. Castillo, Iain W. Chalmers, Mikkel Christensens, Sandra W. Clifton, Céline Cosseau, Christine Coustau, Richard M. Cripps, Yesid Cuesta-Astroz, Scott F. Cummins, Leon Di Stefano, Nathalie Dinguirard, David Duval, Scott Emrich, Cédric Feschotte, René Feyereisen, Peter Fitzgerald, Catrina Fronick, Lucinda A. Fulton, Richard Galinier, Sandra Grossi Gava, Michael E. Geusz, Kathrin K. Geyer, Gloria I. Giraldo-Calderón, Matheus de Souza Gomes, Michelle A. Gordy, Benjamin Gourbal, Christoph Grunau, Patrick C. Hanington, Karl F. Hoffmann, Daniel Hughes, Judith Humphries, Daniel J. Jackson, Liana K. Jannotti-Passos, Wander de Jesus Jeremias, Susan Jobling, Bishoy Kamel, Aurélie Kapusta, Satwant Kaur, Joris M. Koene, Andrea B. Kohn, Daniel Lawson, Scott P. Lawton, Di Liang, Yanin Limpanont, Sijun Liu, Anne E. Lockyer, TyAnna L. Lovato, Fernanda Ludolf, Vincent Magrini, Donald P. McManus, Monica Medina, Milind Misra, Guillaume Mitta, Gerald M. Mkoji, Michael J. Montague, Cesar Montelongo Hernandez, Leonid L. Moroz, Monica C. Munoz-Torres, Umar Niazi, Leslie R. Noble, Francislon S. Oliveira, Fabiano Pais, Anthony T. Papenfuss, Rob Peace, Janeth J. Peña, Emmanuel A. Pila, Titouan Quelais, Brian J. Raney, Jonathan P. Rast, David Rollinson, Izinara Cruz Rosse, Bronwyn A. Rotgans, Edwin J. Routledge, Kathryn M. Ryan, Larissa L. S. Scholte, Kenneth B. Storey, Martin Swain, Jacob A. Tennessen, Chad Tomlinson, Damian L. Trujillo, Emanuela V. Volpi, Anthony J. Walker, Tianfang Wang, Ittiprasert Wannaporn, Wesley C. Warren, Xiaojun Wu, Timothy P. Yoshino, Mohammed Yusuf, Si-Ming Zhang, Min Zhao, Richard K. Wilson

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueParasites and Host Interactions
Établissements canadiensUniversity of AlbertaHealth Sciences CentreSunnybrook Health Science CentreUniversity of TorontoCarleton University
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institute of General Medical SciencesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilCenter for Evolutionary and Theoretical ImmunologyNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaAmerican Heart AssociationCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas GeraisConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoNational Human Genome Research InstituteNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekAgence Nationale de la RechercheNational Centre for the Replacement, Refinement and Reduction of Animals in Research
Mots-clésSnailBiomphalaria glabrataBiologySchistosomiasisBiomphalariaIntermediate hostGenomeFreshwater snailSchistosoma mansoniFreshwater molluscTransmission (telecommunications)Host (biology)EcologyZoologyHelminthsGeneGeneticsComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Biomphalaria snails are instrumental in transmission of the human blood fluke Schistosoma mansoni. With the World Health Organization's goal to eliminate schistosomiasis as a global health problem by 2025, there is now renewed emphasis on snail control. Here, we characterize the genome of Biomphalaria glabrata, a lophotrochozoan protostome, and provide timely and important information on snail biology. We describe aspects of phero-perception, stress responses, immune function and regulation of gene expression that support the persistence of B. glabrata in the field and may define this species as a suitable snail host for S. mansoni. We identify several potential targets for developing novel control measures aimed at reducing snail-mediated transmission of schistosomiasis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,333
Écart entre enseignants0,310 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations314
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueNature CommunicationsMême sujetParasites and Host InteractionsTravaux en français237 207