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Enregistrement W2618122943 · doi:10.1038/ncomms15382

Large scale meta-analysis characterizes genetic architecture for common psoriasis associated variants

2017· review· en· W2618122943 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2017
Typereview
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiquePsoriasis: Treatment and Pathogenesis
Établissements canadiensMemorial University of NewfoundlandToronto Western HospitalUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesEuropean Regional Development FundNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesMedical Research CouncilNational Institutes of HealthTartu ÜlikoolHeinz Nixdorf StiftungDeutsche ForschungsgemeinschaftExzellenzclusters EntzündungsforschungNational Research FoundationKing's College LondonPsoriasis AssociationNational Human Genome Research InstituteWellcome TrustNational Psoriasis FoundationHelene Morgan Babcock and Alfred Babcock Memorial Scholarship TrustA. Alfred Taubman Medical Research InstituteDermatology FoundationBundesministerium für Bildung und ForschungNational Institute for Health and Care ResearchArthritis National Research FoundationU.S. Department of Veterans AffairsFoundation for the National Institutes of Health
Mots-clésPsoriasisGenome-wide association studyGenetic architectureHeritabilityGeneticsGenetic associationBiologyMeta-analysisComputational biologyMedicineQuantitative trait locusSingle-nucleotide polymorphismImmunologyGeneGenotypeInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Psoriasis is a complex disease of skin with a prevalence of about 2%. We conducted the largest meta-analysis of genome-wide association studies (GWAS) for psoriasis to date, including data from eight different Caucasian cohorts, with a combined effective sample size >39,000 individuals. We identified 16 additional psoriasis susceptibility loci achieving genome-wide significance, increasing the number of identified loci to 63 for European-origin individuals. Functional analysis highlighted the roles of interferon signalling and the NFκB cascade, and we showed that the psoriasis signals are enriched in regulatory elements from different T cells (CD8 + T-cells and CD4 + T-cells including T H 0, T H 1 and T H 17). The identified loci explain ∼28% of the genetic heritability and generate a discriminatory genetic risk score (AUC=0.76 in our sample) that is significantly correlated with age at onset ( p= 2 × 10 −89 ). This study provides a comprehensive layout for the genetic architecture of common variants for psoriasis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Études des sciences et des technologies, Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,614
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0050,006
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0020,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0040,001
Intégrité de la recherche0,0030,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,122
Tête enseignante GPT0,378
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle