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Enregistrement W2620071155 · doi:10.18632/oncotarget.18070

Lysine methylation of FEN1 by SET7 is essential for its cellular response to replicative stress

2017· article· en· W2620071155 sur OpenAlexafffundabout
Palaniraja Thandapani, Anthony M. Couturier, Zhenbao Yu, Xing Li, Jean‐François Couture, Shawn Li, Jean‐Yves Masson, Stéphane Richard

Notice bibliographique

RevueOncotarget · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensWestern UniversityUniversity of OttawaUniversité LavalMcGill UniversityJewish General Hospital
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéHealth Canada
Mots-clésMethylationDNA repairBiologyOkazaki fragmentsMethyltransferaseDNA replicationHistoneDNA damageHistone methyltransferaseDNA methylationCell biologyHistone H4Molecular biologyBiochemistryDNAEukaryotic DNA replicationGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

// Palaniraja Thandapani 1,2,* , Anthony M. Couturier 3,* , Zhenbao Yu 1,2 , Xing Li 4 , Jean-François Couture 5 , Shawn Li 3 , Jean-Yves Masson 3 and Stéphane Richard 1,2 1 Terry Fox Molecular Oncology Group and Bloomfield Center for Research on Aging, Lady Davis Institute for Medical Research, Jewish General Hospital, Montréal, Québec, Canada 2 Departments of Oncology and Medicine, McGill University, Montréal, Québec, Canada 3 Genome Stability Laboratory, Laval University Cancer Research Center, CRCHU de Québec, Québec, Canada 4 Department of Biochemistry, Schulich School of Medicine and Dentistry, Western University, London, Ontario, Canada 5 Ottawa Institute of Systems Biology, Department of Biochemistry, Microbiology, and Immunology, University of Ottawa, Ottawa, Ontario, Canada * These authors have contributed equally to this work Correspondence to: Jean-Yves Masson, email: // Stéphane Richard, email: // Keywords : lysine methylation, SET7, FEN1, DNA damage response, DNA replication Received : April 12, 2017 Accepted : April 18, 2017 Published : May 22, 2017 Abstract The DNA damage response (DDR) is central to the cell survival and it requires post-translational modifications, in part, to sense the damage, amplify the signaling response and recruit and regulate DNA repair enzymes. Lysine methylation of histones such as H4K20 and non-histone proteins including p53 has been shown to be essential for the mounting of the DDR. It is well-known that the lysine methyltransferase SET7 regulates the DDR, as cells lacking this enzyme are hypersensitive to chemotherapeutic drugs. To define addition substrates of SET7 involved in the DDR, we screened a peptide array encompassing potential lysine methylation sites from >100 key DDR proteins and identified peptides from 58 proteins to be lysine methylated defining a methylation consensus sequence of [S>K - 2 ; S>R - 1 ; K 0 ] consistent with previous findings. We focused on K377 methylation of the Flap endonuclease 1 (FEN1), a structure specific endonuclease with important functions in Okazaki fragment processing during DNA replication as a substrate of SET7. FEN1 was monomethylated by SET7 in vivo in a cell cycle dependent manner with levels increasing as cells progressed through S phase and decreasing as they exited S phase, as detected using K377me1 specific antibodies. Although K377me1 did not affect the enzymatic activity of FEN1, it was required for the cellular response to replicative stress by FEN1. These finding define FEN1 as a new substrate of SET7 required for the DDR.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,072
Score d'incertitude au seuil0,504

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,321
Écart entre enseignants0,307 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2017
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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