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Enregistrement W2620092731 · doi:10.1371/journal.pone.0178489

Identification of function-regulating antibodies targeting the receptor protein tyrosine phosphatase sigma ectodomain

2017· article· en· W2620092731 sur OpenAlexafffund
Chia‐Lun Wu, Serge Hardy, Isabelle Aubry, Mélissa Landry, Allison Haggarty, H. Uri Saragovi, Michel L. Tremblay

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Tyrosine Phosphatases
Établissements canadiensMcGill UniversityOccupational Cancer Research Centre
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchAzrieli FoundationIsrael Science FoundationInternational Development Research Centre
Mots-clésEctodomainProtein tyrosine phosphataseHeparan sulfateLuciferaseChondroitin sulfateNeuriteCell biologyPhosphatasePleiotrophinBiochemistryTyrosineChemistryReceptorBiologyGlycosaminoglycanPhosphorylationIn vitroTransfectionGrowth factorGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Receptor tyrosine phosphatase sigma (RPTPσ) plays an important role in the regulation of axonal outgrowth and neural regeneration. Recent studies have identified two RPTPσ ligands, chondroitin sulfate proteoglycans (CSPGs) and heparan sulfate proteoglycans (HSPG), which can modulate RPTPσ activity by affecting its dimerization status. Here, we developed a split luciferase assay to monitor RPTPσ dimerization in living cells. Using this system, we demonstrate that heparin, an analog of heparan sulfate, induced the dimerization of RPTPσ, whereas chondroitin sulfate increased RPTPσ activity by inhibiting RPTPσ dimerization. Also, we generated several novel RPTPσ IgG monoclonal antibodies, to identify one that modulates its activity by inducing/stabilizing dimerization in living cells. Lastly, we demonstrate that this antibody promotes neurite outgrowth in SH-SY5Y cells. In summary, we demonstrated that the split luciferase RPTPσ activity assay is a novel high-throughput approach for discovering novel RPTPσ modulators that can promote axonal outgrowth and neural regeneration.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,518

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,243
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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