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Enregistrement W2621807230 · doi:10.2527/asasann.2017.340

340 Metabolomics-based profiling identifies serum signatures that predict the risk of metritis in transition dairy cows

2017· article· en· W2621807230 sur OpenAlexaff
Guanshi Zhang, Qiming Deng, Raju K. Mandal, David S. Wishart, Burim N. Ametaj

Notice bibliographique

RevueJournal of Animal Science · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueRuminant Nutrition and Digestive Physiology
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMetritisMetaboliteMetabolomicsMetabolomeUnivariate analysisRetained placentaEndometritisChemistryInternal medicineAnimal scienceChromatographyMedicineMultivariate analysisBiologyIce calvingPregnancyLactationPlacenta

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The objectives of this study were to identify metabolite signatures in the blood of dairy cows before, during, and after diagnosis of metritis that could be used to predict the risk of metritis in transition dairy cows. Direct-injection liquid chromatography–tandem mass spectroscopy was used to analyze serum samples collected from both 20 healthy (CON) and 6 metritic cows during −8 and −4 wk, at disease diagnosis, and +4 and +8 wk relative to parturition. Univariate (Wilcoxon–Mann–Whitney test by R; statistical significance: P < 0.05) and multivariate data (i.e., principal component analysis and partial least squares discriminant analysis [PLS-DA]; permutation test for the PLS-DA model, P < 0.05) analyses were conducted to examine alterations of serum metabolites throughout the progress of the disease. Results from univariate analysis indicated that cows with metritis experienced altered concentrations of multiple serum AA, glycerophospholipids, sphingolipids, acylcarnitines, and hexose during the entire experimental period. Principal component analysis and PLS-DA analyses showed clearly separated clusters for the 2 groups on the basis of measured serum metabolites during 5 time points. It is interesting to note that throughout the 17 wk of the study, several serum metabolites (e.g., PC aa C30:0, PC ae C30:1, SM [OH] C24:1, and SM C24:0) appeared to play a consistent role in distinguishing between the CON and metritic cows. For example, concentrations of PC ae C30:1 were consistently 2-fold greater in premetritic (i.e., mean of 3.10 μM [SEM 0.46] vs. mean of 1.32 μM [SEM 0.18; P = 0.002] at −8 wk prepartum and mean of 1.91 μM [SEM 0.22] vs. mean of 0.83 μM [SEM 0.10; P = 0.001] at −4 wk prepartum) and metritic (1.89 ± 0.23 vs. 0.90 ± 0.11; P = 0.001 at the disease week) cows compared with CON cows. Furthermore, 5 metabolic pathways (i.e., Lys degradation, biotin metabolism, Trp metabolism, Val–Leu–Ile degradation, and protein biosynthesis) were altered in both premetritic and metritic cows. These new findings give insights into the pathomechanism of metritis in dairy cows. Moreover, the area under the curve for 5 ROC curves was 0.995 (95% CI 0.945 to 1) at −8 wk, 0.992 (95% CI 0.938 to 1) at −4 wk, 0.988 (95% CI 0.913 to 1) at disease week, 1 (95% CI 1 to 1) at +4 wk, and 0.99 (95% CI 1 to 1) at 8 wk, respectively, which suggests that serum biomarkers identified have pretty accurate predictive, diagnostic, and prognostic abilities for metritis in transition dairy cows.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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