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Enregistrement W2621944282

Bazooka and atypical Protein Kinase C regulate dynamic actomyosin networks during Drosophila amnioserosa apical constriction

2013· dissertation· en· W2621944282 sur OpenAlexfundno aff
Daryl J. V. David

Notice bibliographique

RevueTSpace (University of Toronto) · 2013
Typedissertation
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeurobiology and Insect Physiology Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of Toronto
Mots-clésDrosophila (subgenus)Apical constrictionCell biologyBiologyChemistryBiochemistryMorphogenesisGene
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cell shape changes drive tissue remodeling. Polarized activity of actin and myosin drive apical constriction, as seen for example in Drosophila embryonic amnioserosa cells during dorsal closure (DC). My first aim was to characterize interactions between apical actomyosin networks and the cell polarity regulators Bazooka (Baz, the Drosophila Par-3), Par-6, and atypical Protein Kinase C (aPKC) (the PAR complex) during Drosophila DC. I found that both actomyosin networks and the PAR complex are enriched at the apical surfaces of amnioserosa cells and that actomyosin contractility is driven by cyclical assembly and disassembly of actomyosin networks. The pulsatile actomyosin networks translocate across persistent apical surface PAR complex puncta. To assess whether the PAR complex interacts with actomyosin, I characterized myosin dynamics with PAR loss- and gain-of-function perturbations. Baz enhances, whereas Par6/aPKC inhibits actomyosin. These studies suggest that PAR proteins regulate pulsatile apical actomyosin networks mediating constriction of amnioserosa cells. My next aim was to characterize actomyosin networks during a shift in their dynamics. Amnioserosa constriction transitions from pulsatile to persistent from early to late DC. Since oscillatory networks result from delayed negative feedback, I examined whether such regulation exists in these actomyosin networks. The actomyosin inhibitor aPKC is recruited to the apical surface by actomyosin and, in turn, aPKC recruits Baz. To examine the significance of Baz – aPKC dynamic interactions, I ectopically stabilized their interactions. This served to inhibit the antagonism of actomyosin networks by aPKC, suggesting that Baz can act as a competitive inhibitor of aPKC. I found that interactions between Par-6 and Baz increase during DC, suggesting an increase in aPKC inhibition during DC progression. To examine whether decreased inhibition can tune oscillatory actomyosin networks, we collaborated with Qiming Wang and Dr. James Feng (University of British Columbia) to test this oscillation in silico. Computer modeling suggests that decreasing delayed negative feedback can transition actomyosin oscillations towards stabilized constriction. Together, these results demonstrate the requirement of Baz – aPKC interactions for their localization and for dynamic regulation of aPKC by a competitive inhibitor. Finally, my research reveals a regulatory circuit to tune actomyosin behaviour during development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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