MOLECULAR AND FUNCTIONAL CHARACTERIZATION OF THE lpdA1 GENE IN S. meliloti
Notice bibliographique
Résumé
The alfalfa-Sinorhizobium symbiosis is one of the best studied for plant-microbe associations. The pyruvate dehydrogenase complex catalyzes the key metabolic step connecting the glycolysis to the Tricarboxylic acid (TCA) cycle. The PDH also participates in anaplerotic synthesis of acetyl-CoA in bacteroids, or when grown in the presence of dicarboxylic acids as the sole carbon sources. The complex consists of multiple copies of the three subunits, pyruvate dehydrogenase (EC 1.2.4.1), that acts as the E1 component of the complex, dihydrolipoamide transacetylase (EC 2.3.1.12), the E2 component, and dihydrolipoamide dehydrogenase (EC 1.8.1.4), that participates as the E3 subunit. The lpdA1 gene was mutated through the site-directed, single crossover recombination, using modified pVIK112 suicide plasmids. The lpdA1 mutant failed to grow on pyruvate, and was significantly delayed on other tested carbon sources. The activity of the pyruvate dehydrogenase complex was not detected in this mutant, and the regulation of the lpdA1 was not dependent on the presence of pyruvate. This mutant was Nod+, but appeared Fix-.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».