MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2622721107 · doi:10.5539/jas.v9n7p22

14-3-3 Lambda Protein Affects Anthocyanin Production in Arabidopsis thaliana during Drought Stress

2017· article· en· W2622721107 sur OpenAlexvenueno aff
Fizal Nabbie, Jordan N. Smith, Serhiy Hnatyshyn, Bethanne M. Warrack, Huidong Gu, Daniel Merenich, Kenneth Myers, Bela Peethambaran

Notice bibliographique

RevueJournal of Agricultural Science · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
Thématique14-3-3 protein interactions
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPhenylpropanoidMetabolomicsAnthocyaninArabidopsis thalianaMetabolitePetunidinMutantBiologyArabidopsisWild typeBiochemistryChemistryBotanyGeneBiosynthesisMalvidinCyanidinBioinformatics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Plants evolve to adapt to environmental stresses, including changes at the genetic and molecular levels. For bioengineers to utilize genetic manipulation to build tolerance into crops, a better understanding of the mechanism is needed. Published studies have demonstrated that 14-3-3 Lambda (14-3-3 Lambda) protein affect the phenylpropanoid (Pp) biosynthetic pathway and alters production of flavonoids and downstream compounds of importance for stress tolerance. The 14-3-3 family of proteins binds to many different client proteins and serves as signaling scaffolds. In this study 14-3-3 Lambda knockout mutants were used to investigate changes in metabolite accumulation in the downstream Pp pathway. Amongst them are anthocyanins which are important antioxidants involved in a variety of plant functions including stress response. Investigating how drought stress influenced anthocyanin production identified nodes in the Pp pathway affected by 14-3-3 Lambda. A metabolomics analysis employing high resolution mass spectrometry (HRMS) and metabolomics software was used to identify metabolites in 14-3-3 knockout which changed relative to wild-type A. thaliana (Columbia-0) during drought stress. The metabolites Cy-3-p-coumaurolysinapoylsophoroside-5-diglucoside, 3-caffeoylferuloylsophoroside- 5-succinoylglucoside, 3-caffeoylferuloylsophoroside-5-malonyldiglucoside, 3-feruloylsophoroside-5-succinoyl glucoside, petunidin-3,5-O-diglucoside and malvidin-3-O-p-coumarylmonoglucoside show significant differences in their profiles ranging from 18- to > 500-fold between the Col-0 and 14-3-3 Lambda knockout in wet and dry groups. The findings suggest that 14-3-3 Lambda interacts along the CHS, and CHI nodes, which in turn regulate the downstream production of specific anthocyanins. The interaction of 14-3-3 Lambda with CHS was confirmed using co-immunoprecipitation and co-localization studies. This study supports the hypothesis that manipulation of gene expression of 14-3-3 Lambda can lead to development of drought tolerance in plants.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,396
Score d'incertitude au seuil0,343

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Agricultural ScienceMême sujet14-3-3 protein interactionsTravaux en français237 207