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Enregistrement W2624335570 · doi:10.1111/jfb.13345

Biosynthesis of 1α‐hydroxycorticosterone in the winter skate <i>Leucoraja ocellata</i>: evidence to suggest a novel steroidogenic route

2017· article· en· W2624335570 sur OpenAlexafffund
Julia Wiens, Ryan Calvin Ho, Ann Karen C. Brassinga, Courtney A. Deck, Patrick J. Walsh, Robert N. Ben, Kyle McClymont, Thomas A. Charlton, Andrew N. Evans, W. Gary Anderson

Notice bibliographique

RevueJournal of Fish Biology · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSteroid Chemistry and Biochemistry
Établissements canadiensUniversity of OttawaUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesCanada Research Chairs
Mots-clésBiologyRhodococcusHydroxylationBacteriaSteroidSkateActinobacteriaBiochemistryMetabolismMicrobiologyEnzymeGenetics16S ribosomal RNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The present study explores the ability of intracellular bacteria within the renal‐inter‐renal tissue of the winter skate Leucoraja ocellata to metabolize steroids and contribute to the synthesis of the novel elasmobranch corticosteroid, 1α‐hydroxycorticosterone (1α‐ OH ‐B). Despite the rarity of C1 hydroxylation noted in the original identification of 1α‐ OH ‐B, literature provides evidence for steroid C1 hydroxylation by micro‐organisms. Eight ureolytic bacterial isolates were identified in the renal‐inter‐renal tissue of L. ocellata , the latter being the site of 1α‐ OH ‐B synthesis. From incubations of bacterial isolates with known amounts of potential 1α‐ OH ‐B precursors, one isolate UM008 of the genus Rhodococcus was seen to metabolize corticosteroids and produce novel products via HPLC analysis. Cations Zn 2+ and Fe 3+ altered metabolism of certain steroid precursors, suggesting inhibition of Rhodococcus steroid catabolism. Genome sequencing of UM008 identified strong sequence and structural homology to that of Rhodococcus erythropolis PR4 . A complete enzymatic pathway for steroid‐ring oxidation as documented within other Actinobacteria was identified within the UM008 genome. This study highlights the potential role of Rhodococcus bacteria in steroid metabolism and proposes a novel alternative pathway for 1α‐ OH ‐B synthesis, suggesting a unique form of mutualism between intracellular bacteria and their elasmobranch host.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,609

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,303
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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