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Enregistrement W2625977525 · doi:10.1371/journal.pmed.1002314

Estimating the causal influence of body mass index on risk of Parkinson disease: A Mendelian randomisation study

2017· article· en· W2625977525 sur OpenAlexfundno aff
Alastair J. Noyce, Demis A. Kia, Gibran Hemani, Aude Nicolas, T. Ryan Price, Eduardo De Pablo‐Fernández, Philip Haycock, Patrick A. Lewis, Thomas Foltynie, George Davey Smith, Anette Schrag, Andrew Lees, John Hardy, Andrew Singleton, Mike A. Nalls, Neil Pearce, Debbie A. Lawlor, Nicholas Wood

Notice bibliographique

RevuePLoS Medicine · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Environmental Health SciencesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institutes of HealthBritannia PharmaceuticalsH. Lundbeck A/SBundesministerium für Bildung und ForschungAgence Nationale de la RechercheNational Cancer InstituteLandspítali HáskólasjúkrahúsUniversity of BristolUniversity of SheffieldInstitute of GeneticsBarts CharityBrain Research TrustParkinson's UKBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilUniversity College LondonWellcome TrustCancer Research UKFoundation for Barnes-Jewish HospitalProthenaEU Joint Programme – Neurodegenerative Disease ResearchNIHR Sheffield Biomedical Research CentreAstex PharmaceuticalsUniversity of DundeeHelsingin ja Uudenmaan SairaanhoitopiiriAssociation France ParkinsonEuropean CommissionHelsingin YliopistoAmerican Parkinson Disease AssociationMichael J. Fox Foundation for Parkinson's ResearchU.S. Department of DefenseItä-Suomen YliopistoNational Institute on AgingNational Institute for Health and Care ResearchMedical Research CouncilHersenstichtingTeva Pharmaceutical IndustriesNIHR Biomedical Research Centre, Royal Marsden NHS Foundation Trust/Institute of Cancer ResearchU.S. Department of Health and Human Services
Mots-clésBody mass indexPleiotropyConfoundingGenome-wide association studyOdds ratioMendelian randomizationMedicineDemographyGenetic associationInternal medicineGeneticsSingle-nucleotide polymorphismBiologyGenetic variantsGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Both positive and negative associations between higher body mass index (BMI) and Parkinson disease (PD) have been reported in observational studies, but it has been difficult to establish causality because of the possibility of residual confounding or reverse causation. To our knowledge, Mendelian randomisation (MR)-the use of genetic instrumental variables (IVs) to explore causal effects-has not previously been used to test the effect of BMI on PD. METHODS AND FINDINGS: Two-sample MR was undertaken using genome-wide association (GWA) study data. The associations between the genetic instruments and BMI were obtained from the GIANT consortium and consisted of the per-allele difference in mean BMI for 77 independent variants that reached genome-wide significance. The per-allele difference in log-odds of PD for each of these variants was estimated from a recent meta-analysis, which included 13,708 cases of PD and 95,282 controls. The inverse-variance weighted method was used to estimate a pooled odds ratio (OR) for the effect of a 5-kg/m2 higher BMI on PD. Evidence of directional pleiotropy averaged across all variants was sought using MR-Egger regression. Frailty simulations were used to assess whether causal associations were affected by mortality selection. A combined genetic IV expected to confer a lifetime exposure of 5-kg/m2 higher BMI was associated with a lower risk of PD (OR 0.82, 95% CI 0.69-0.98). MR-Egger regression gave similar results, suggesting that directional pleiotropy was unlikely to be biasing the result (intercept 0.002; p = 0.654). However, the apparent protective influence of higher BMI could be at least partially induced by survival bias in the PD GWA study, as demonstrated by frailty simulations. Other important limitations of this application of MR include the inability to analyse non-linear associations, to undertake subgroup analyses, and to gain mechanistic insights. CONCLUSIONS: In this large study using two-sample MR, we found that variants known to influence BMI had effects on PD in a manner consistent with higher BMI leading to lower risk of PD. The mechanism underlying this apparent protective effect warrants further study.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,098
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,167
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,098
Score d'incertitude au seuil0,516

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0980,167
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,006
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,302
Écart entre enseignants0,284 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations186
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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