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Enregistrement W2626753829 · doi:10.1186/s13104-017-2526-8

A loss of Pdxk model of Parkinson disease in Drosophila can be suppressed by Buffy

2017· article· en· W2626753829 sur OpenAlexafffund
P Githure M'angale, Brian E. Staveley

Notice bibliographique

RevueBMC Research Notes · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueParkinson's Disease Mechanisms and Treatments
Établissements canadiensMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMemorial University of NewfoundlandUniversity of MelbourneUniversity of Virginia
Mots-clésDrosophila melanogasterRNA interferenceBiologyDopaminergicCell biologyPhenotypeModel organismAromatic L-amino acid decarboxylaseKinaseGene expressionGeneGeneticsDopamineRNANeuroscience

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The identification of a DNA variant in pyridoxal kinase (Pdxk) associated with increased risk to Parkinson disease (PD) gene led us to study the inhibition of this gene in the Dopa decarboxylase (Ddc)-expressing neurons of the well-studied model organism Drosophila melanogaster. The multitude of biological functions attributable to the vitamers catalysed by this kinase reveal an overabundance of possible links to PD, that include dopamine synthesis, antioxidant activity and mitochondrial function. Drosophila possesses a single homologue of Pdxk and we used RNA interference to inhibit the activity of this kinase in the Ddc-Gal4-expressing neurons. We further investigated any association between this enhanced disease risk gene with the established PD model induced by expression of α-synuclein in the same neurons. We relied on the pro-survival functions of Buffy, an anti-apoptotic Bcl-2 homologue, to rescue the Pdxk-induced phenotypes. RESULTS: To drive the expression of Pdxk RNA interference in DA neurons of Drosophila, we used Ddc-Gal4 which drives expression in both dopaminergic and serotonergic neurons, to result in decreased longevity and compromised climbing ability, phenotypes that are strongly associated with Drosophila models of PD. The inhibition of Pdxk in the α-synuclein-induced Drosophila model of PD did not alter longevity and climbing ability of these flies. It has been previously shown that deficiency in vitamers lead to mitochondrial dysfunction and neuronal decay, therefore, co-expression of Pdxk-RNAi with the sole pro-survival Bcl-2 homologue Buffy in the Ddc-Gal4-expressing neurons, resulted in increased survival and a restored climbing ability. In a similar manner, when we inhibited Pdxk in the developing eye using GMR-Gal4, we found that there was a decrease in the number of ommatidia and the disruption of the ommatidial array was more pronounced. When Pdxk was inhibited with the α-synuclein-induced developmental eye defects, the eye phenotypes were unaltered. Interestingly co-expression with Buffy restored ommatidia number and decreased the severity of disruption of the ommatidial array. CONCLUSIONS: Though Pdxk is not a confirmed Parkinson disease gene, the inhibition of this kinase recapitulated the PD-like symptoms of decreased lifespan and loss of locomotor function, possibly producing a new model of PD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,129
Score d'incertitude au seuil0,577

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,151
Tête enseignante GPT0,401
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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